| 中间锦鸡儿FAD2基因拷贝数检测及组织表达谱分析 |
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| 引用本文： | 林萍,汪阳东,齐力旺,张守攻. 中间锦鸡儿FAD2基因拷贝数检测及组织表达谱分析[J]. 西北农林科技大学学报(自然科学版), 2010, 38(1): 119-124 |
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| 作者姓名： | 林萍 汪阳东 齐力旺 张守攻 |
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| 作者单位： | 中国林业科学研究院亚热带林业研究所;中国林业科学研究院林业研究所; |
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| 基金项目： | 国家“十一五”科技支撑专题(2006BAD01A1606) |
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| 摘 要： | 【目的】探索中间锦鸡儿基因组中FAD2基因的拷贝数,分析不同拷贝的表达模式,以期揭示不同拷贝在植物体内的功能分工。【方法】根据中间锦鸡儿(Caragana intermedia)FAD2基因的保守序列设计1对引物SF和SR,利用该引物对PCR扩增制备114 bp的Southern检测探针,探针进行地高辛标记后,采用罗氏Southern杂交试剂盒进行Southern检测。根据中间锦鸡儿3个FAD2基因各自的特异差异序列,分别设计定量PCR引物序列,以actin基因为内参,对中间锦鸡儿的根、茎、叶及不同发育时期(发芽15,25,35 d)种子的cDNA进行定量PCR分析。【结果】中间锦鸡儿FAD2基因至少有4个拷贝,且不同拷贝的表达模式不同。FAD2-2A基因在根和发育中期、后期的种子中低水平表达,在幼嫩的茎、叶以及发育早期的种子中高水平表达;FAD2-1A基因在根中的表达量最低,在种子发育早期、中期大量表达,在幼嫩叶子中表达水平也较高;FAD2-1B基因仅在种子发育中期大量表达,在其他组织及种子其他发育阶段的表达量均保持在本底水平。在不同组织以及种子的不同发育时期,FAD2-1A相对表达量的变化幅度最大,达到了近100倍,FAD2-1B次之,FAD2-2A最小。【结论】结合序列比对分析推测:FAD2-2A基因可能主要负责合成膜脂中的亚油酸,FAD2-1A主要负责种子及叶子贮脂中亚油酸的合成,FAD2-1B负责种子贮脂中油酸的去饱和作用。
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| 关 键 词： | 中间锦鸡儿 FAD2基因 实时定量PCR 表达谱 |
| 收稿时间： | 2009-05-08 |
Copy detection and expression profile analysis of FAD2 genes in Caragana intermedia |
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| LIN Ping,WANG Yang-dong,QI Li-wang and ZHANG Shou-gong. Copy detection and expression profile analysis of FAD2 genes in Caragana intermedia[J]. Journal of Northwest A&F University（Natural Science Edition）, 2010, 38(1): 119-124 |
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| Authors: | LIN Ping WANG Yang-dong QI Li-wang ZHANG Shou-gong |
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| Affiliation: | LIN Pinga,WANG Yang-donga,QI Li-wangb,ZHANG Shou-gongb(a Research Institute of Subtropical Forestry,Fuyang,Zhejiang 311400,China,b Research Institute of Forestry,Chinese Academy of Forestry,Beijing 100091,China) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Caragana intermedia FAD2 gene Real-time PCR expression profile |
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