α-tubulin基因的克隆、生物信息学分析及其在仿刺参肠道再生过程中的表达模式 |
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引用本文: | 王怡,高银雪,湛垚垚,张向向,杨立猛,常亚青.α-tubulin基因的克隆、生物信息学分析及其在仿刺参肠道再生过程中的表达模式[J].水产学报,2016,40(4):547-557. |
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作者姓名: | 王怡 高银雪 湛垚垚 张向向 杨立猛 常亚青 |
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作者单位: | 大连海洋大学农业部北方海水增养殖重点实验室,辽宁大连,116023 |
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基金项目: | 国家"八六三"高技术研究发展计划(2012AA10A412);辽宁省农业攻关及成果产业化项目(2015203003) |
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摘 要: | 为了明确仿刺参α-微管蛋白(α-tubulin)基因的序列及结构信息,初步研究该基因在仿刺参肠道再生过程中的生物学功能,本研究利用转录组数据挖掘和c DNA末端快速扩增技术(RACE)首次克隆得到仿刺参α-tubulin基因的全长c DNA序列。结果表明,仿刺参α-tubulin基因c DNA全长为1641 bp,共编码453个氨基酸,经生物信息学分析发现,该基因的5'端非编码区为153 bp,3'端非编码区为126 bp,推算该基因所编码的蛋白质分子量为50.33 ku,等电点为4.89,属于亲水性非跨膜蛋白质,且氨基酸序列中含有微管蛋白特有的信号序列GGGTGSG。通过与13种已公布物种的α-tubulin氨基酸序列进行多重序列比对及系统进化分析,发现仿刺参α-tubulin蛋白的氨基酸序列与其他真核生物的α-tubulin蛋白序列具有非常高的保守性,与南极岩斑鳕α-tubulin相似性高达90%。采用实时定量PCR技术对α-tubulin基因在仿刺参肠组织再生不同时期的表达情况进行检测,结果显示α-tubulin基因在仿刺参肠组织再生不同时期均有表达,其相对表达量在肠组织再生17 d时最高,5 d时最低。本研究在获得仿刺参α-tubulin基因结构信息的同时,进一步印证了真核生物α-tubulin基因的高度保守性,同时表明α-tubulin基因参与仿刺参肠道再生过程。
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关 键 词: | 仿刺参 α-微管蛋白 克隆 生物信息学分析 基因表达 |
收稿时间: | 2015/9/17 0:00:00 |
修稿时间: | 2015/12/30 0:00:00 |
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