| 全基因组分析PEG胁迫下水稻根系转录因子表达变化 |
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| 引用本文： | 马廷臣,陈荣军,余蓉蓉,曾汉来,张端品. 全基因组分析PEG胁迫下水稻根系转录因子表达变化[J]. 作物学报, 2009, 35(6): 1030-1037. DOI: 10.3724/SP.J.1006.2009.01030 |
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| 作者姓名： | 马廷臣 陈荣军 余蓉蓉 曾汉来 张端品 |
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| 作者单位： | 1.华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室，湖北武汉430070；2中国科学院亚热带农业生态研究所，湖南长沙410125 |
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| 基金项目： | 中国科学院知识创新工程领域前沿项目 |
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| 摘 要： | 转录因子在植物抗逆境中起重要的调节作用。本文使用Affymetrix水稻60K芯片全基因组研究PEG胁迫时2个耐旱性不同的水稻品种的转录因子及转录因子家族的变化，结果表明，在PEG胁迫下，耐旱品种湘丰早119根系共有95个转录因子转录本与对照处理比较表达发生变化(24个为转录水平下调表达, 71个为转录水平上调表达)；干旱敏感品种爱华5号根系有129个转录因子转录本表达发生变化(转录水平上调的转录因子转录本60个，转录水平下调的转录因子转录本69个)；2个品种PEG胁迫响应转录因子隶属的转录因子家族都为30个，但各转录因子所属的30个家族并不完全相同；PEG胁迫逆境中，PEG胁迫响应转录因子转录本表现出品种特异性，湘丰早119有72个为特异响应转录本，爱华5号有106个特异响应的转录因子转录本；2个品种在干旱胁迫下响应的转录因子有23个为重叠转录本，其中有16个在转录水平上调表达，7个在转录水平下调表达；2个品种的PEG胁迫响应转录因子基因在染色体上的分布不同，重叠转录因子基因主要位于第2染色体0.432~26.139 Mb和第5染色体0.076~20.597 Mb之间。
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| 关 键 词： | 水稻 根系 基因芯片 转录因子 耐旱性差异 |
| 收稿时间： | 2008-12-10 |
Global Genome Expression Analysis of Transcription Factors under PEG Osmotic Stress in Rice Root System |
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| MA Ting-Chen,CHEN Rong-Jun,YU Rong-Rong,ZENG Han-Lai,ZHANG Duan-Pin. Global Genome Expression Analysis of Transcription Factors under PEG Osmotic Stress in Rice Root System[J]. Acta Agronomica Sinica, 2009, 35(6): 1030-1037. DOI: 10.3724/SP.J.1006.2009.01030 |
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| Authors: | MA Ting-Chen CHEN Rong-Jun YU Rong-Rong ZENG Han-Lai ZHANG Duan-Pin |
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| Affiliation: | 1.National Key Laboratory of Crop Genetic Improvement, Huazhong Agricultural University,Wuhan 430070,China;2.Institute of Subtropical Agriculture,Chinese Academy of Sciences,Changsha 410125,China |
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| Abstract: | |
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