云南切梢小蠹气味结合蛋白的分子对接 |
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作者姓名: | 汪宇 孙浩 朱家颖 赵宁 杨斌 |
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作者单位: | 1. 西南林业大学/云南省森林灾害预警与控制重点实验室,云南昆明,650224 2. 西南林业大学理学院,云南昆明,650224 |
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基金项目: | 国家自然科学基金(编号31260179);国家林业公益性行业科研专项(编号201004067)。 |
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摘 要: | 为研究云南切梢小蠹(Tomicus yunnanensis)气味结合蛋白(odorant binding proteins,OBPs)参与其嗅觉识别过程的机理,基于气味结合蛋白、绿叶挥发性物质的三维结构,采用分子对接方法对云南切梢小蠹OBP与3个绿叶挥发性物质可能的结合方式和结合能力进行模拟,结果表明,(E)-2-己烯醇较其他2个小分子而言更容易与云南切梢小蠹OBP结合,形成稳定的氢键。(E)-2-己烯醇与Tyun OBP2结合能最低,更容易与Tyun OBP2结合,Tyun OBP2与小分子物质的结合,可能通过占有该蛋白与寄主气味结合的空间或者通过改变Tyun OBP2三维结构,导致Tyun OBP2难以识别寄主松树散发的气味。
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关 键 词: | 气味结合蛋白 分子对接 三维结构 云南切梢小蠹 嗅觉识别 挥发性物质 |
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