AMHR2新型转录本AMHR2-SV1的鉴定及其在大鼠组织中的表达 |
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引用本文: | 郭保平,牛亚茹,徐明龙,徐银学.AMHR2新型转录本AMHR2-SV1的鉴定及其在大鼠组织中的表达[J].江苏农业学报,2015,31(2). |
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作者姓名: | 郭保平 牛亚茹 徐明龙 徐银学 |
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作者单位: | 南京农业大学动物科学技术学院,江苏南京,210095 |
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基金项目: | 南京农业大学科技发展基金项目 |
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摘 要: | 本研究旨在鉴定抗苗勒氏管激素受体2(AMHR2)一种新的转录本,确定其在大鼠组织中的表达情况。采用TRIzol法提取组织总RNA;运用RT-PCR和克隆测序技术分析AMHR2基因的可变剪接体及其在大鼠各组织器官中的表达差异,同时利用NCBI ORF Finder识别剪接体序列阅读框,运用Ex PASy-Prot Param和Conserved domains软件分别预测剪接体氨基酸构成及其性质和剪接体保守序列。AMHR2-SV1是AMHR2的一种新型转录本,命名为AMHR2-splice variant(AMHR2-SV1),与AMHR2参考序列比较,缺失第10外显子137 bp。利用NCBI ORF Finder和Ex PASy-Prot Param,预测AMHR2-SV1编码429个氨基酸残基,其编码的蛋白质分子量为45 990.7。Conserved domains在线软件分析表明:AMHR2-SV1蛋白序列比完整AMHR2蛋白序列缺少128个氨基酸,丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶结构域不完整。检测结果表明,大鼠组织中均存在AMHR2和AMHR2-SV1两个转录本。在肝、脾、肺、肾、肾上腺和子宫组织中AMHR2表达量均高于AMHR2-SV1,差异达到显著水平;两种转录本在不同组织中表达趋势相同,卵巢中表达量最高,心脏中次之,其他组织表达量均显著低于卵巢和心脏。
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关 键 词: | AMHR2 AMHR2-SV1 新型转录本 表达图谱 |
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