首页 | 本学科首页   官方微博 | 高级检索  
     检索      

秋茄WRKY基因家族的生物信息学分析
引用本文:丁祥青,胡敏杰,向双,赖兴凯,乐易迅,刘仲健,邹双全.秋茄WRKY基因家族的生物信息学分析[J].江苏农业科学,2022(14):50-60.
作者姓名:丁祥青  胡敏杰  向双  赖兴凯  乐易迅  刘仲健  邹双全
作者单位:1. 福建农林大学园林学院;2. 福建师范大学地理科学学院;3. 福建农林大学林学院;4. 泉州湾河口湿地自然保护区管理处
摘    要:WRKY蛋白在植物胁迫响应和应答过程中发挥着重要作用。秋茄生长环境恶劣,生存压力使其进化出极强的胁迫响应能力,对各种胁迫的响应是决定秋茄逆境生存的重要因素。目前,关于秋茄WRKY基因家族的研究报道较少。对秋茄WRKY基因家族进行全面的研究,共鉴定出71个KcWRKY基因。结构域分析和进化分析结果表明,KcWRKY基因高度保守且分为3组。保守基序分析结果表明,同组的KcWRKY基因基序分布一致而组间差异显著,说明同组的KcWRKY基因可能具有相似的功能。染色体定位和复制关系表明,71个KcWRKY基因不均匀分布在秋茄基因组18条染色体上,存在4对串联重复基因和大量片段复制基因,这些基因可能在秋茄胁迫响应进化历程中发挥了重要作用。根据KcWRKY基因在不同器官的表达模式推测KcWRKY71参与调节编码线粒体和叶绿体蛋白的胁迫响应,KcWRKY66参与秋茄叶和果衰老的调节。本研究揭示了秋茄WRKY转录因子的基本结构与性质,研究结果能为后续深入研究秋茄WRKY转录因子的功能奠定基础。

关 键 词:秋茄  WRKY转录因子  基因家族  生物信息分析
设为首页 | 免责声明 | 关于勤云 | 加入收藏

Copyright©北京勤云科技发展有限公司  京ICP备09084417号