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柑橘裂皮类病毒广东分离物YC全长cDNA序列克隆及分析
引用本文:丁芳,易干军,王国平,曹庆,洪霓,钟云.柑橘裂皮类病毒广东分离物YC全长cDNA序列克隆及分析[J].分子植物育种,2007,5(6):871-874.
作者姓名:丁芳  易干军  王国平  曹庆  洪霓  钟云
作者单位:华中农业大学植物科学技术学院,武汉,430070;广东省农业科学院果树研究所,广州,510640;华中农业大学国家果树脱毒种质资源室内保存中心,武汉,430070;广东省农业科学院果树研究所,广州,510640;华中农业大学植物科学技术学院,武汉,430070;华中农业大学湖北省作物病害监测与安全控制重点实验室,武汉,430070;广东省农业科学院果树研究所,广州,510640;南昌工程学院,南昌,330099;华中农业大学植物科学技术学院,武汉,430070;华中农业大学国家果树脱毒种质资源室内保存中心,武汉,430070
基金项目:国家高技术研究发展计划(863计划) , 广东省科技攻关计划 , 湖北省科技攻关项目
摘    要:柑橘裂皮类病毒(Citrus exocortis viroid, CEVd)是危害柑橘的重要病原之一,认清该类病毒的分子特性是进一步研究其致病机制的前提.本文利用RT-PCR技术对广东分离物YC的全长cDNA序列进行了扩增、克隆,获得了全长372bp的片段,对该片段进行测序及分析显示:CEVd广东分离物YC的分子结构域包括5个功能区即左手末端区(TL)、致病区(P)、中央保守区(C)、可变区(V)和右手末端区(TR).通过与GenBank已登陆序列的比对分析发现:与来自西班牙的分离物CEVd-f-1(登陆号:EF494677.1)的同源性高达98%;与湖北分离物CEVd-HB(登陆号:AY456136)的同源性仅为92.7%;与强度株系CEVd-A(登陆号:M30868)的同源性为96.8%,与弱毒株系CEVd-de26(登陆号:K00965)的92.4%.说明该广东分离物YC分子特性更接近强毒株系.这是国内首次对柑橘裂皮类病毒cDNA的分子特性进行报道.

关 键 词:裂皮类病毒  全长cDNA  克隆  分析

Cloning and Analyzing a Full Length cDNA of Citrus exocortis Viroid YC Isolate from Guangdong
Ding Fang,Yi Ganjun,Wang Guoping,Cao Qing,Hong Ni,Zhong Yun.Cloning and Analyzing a Full Length cDNA of Citrus exocortis Viroid YC Isolate from Guangdong[J].Molecular Plant Breeding,2007,5(6):871-874.
Authors:Ding Fang  Yi Ganjun  Wang Guoping  Cao Qing  Hong Ni  Zhong Yun
Institution:1. College of Plant Science and Technology, Huazhong Agricultural University, Wuhan, 430070; 2. Institute of Fruit Tree Research, Guangdong Academy of Agricultural Science, Guangzhou, 510640; 3 National Indoor Conservation Center of Virus-free Germplasm of Fruit Crops, Huazhong Agricultural University, Wuhan, 430070; 4 The Key Laboratory of Plant Pathology of Hubei Province, Huazhong Agricultural University, Wuhan, 430070; 5 Nanchang Institute of Technology, Nanchang, 330099
Abstract:
Keywords:Citrus exocortis Viroid  Full length cDNA  Cloning  Analysising
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