| 玉米DUF1685基因家族的鉴定和进化分析 |
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| 引用本文： | 罗璇,林正雨,陈章,雷波,李洁,全津莹,刘海岚. 玉米DUF1685基因家族的鉴定和进化分析[J]. 热带作物学报, 2022, 43(12): 2431-2442. DOI: 10.3969/j.issn.1000-2561.2022.12.005 |
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| 作者姓名： | 罗璇 林正雨 陈章 雷波 李洁 全津莹 刘海岚 |
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| 作者单位： | 1.四川省农业科学院农业信息与农村经济研究所，四川成都 6100662.四川农业大学玉米研究所，四川成都 611130 |
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| 基金项目： | 四川省重点研发项目(2021YFYZ0028);四川省科技计划项目(2020YJ0466) |
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| 摘 要： | 本研究共鉴定出16个单、双子叶植物和卷柏的211个DUF1685基因家族成员。蛋白理化性质分析表明，211个DUF1685s基因的氨基酸序列长度为83~1071 aa，分子量为9.2~116.3 kDa，理论等电点为3.66~11.90。系统发育进化分析表明，DUF1685基因家族被划分了3个亚家族（Class I、Class II和Class III），Class I和Class II亚家族产生A1和A2、B1和B2的事件发生在单、双子叶植物分化后，同时A1和B2分支（成员均为双子叶植物基因）出现了基因扩张现象。保守基序和基因结构分析结果表明，同一亚家族成员之间保守基序相似，211个DUF1685基因家族成员中大部分含有1个内含子，少部分基因含有2个及以上内含子或者不含内含子。选择压分析表明，DUF1685基因家族在进化过程中相关位点受到正向选择，这可能是导致部分基因发生功能变化的原因。共线性分析表明，片段复制事件可能是玉米DUF1685基因扩增和进化的潜在驱动力。基因启动子区域顺式元件分析结果表明，玉米DUF1685基因启动子区域含有光响应元件、ABA和非生物胁迫相关的顺式作用元件，推测这些基因可能参与玉米对非生物胁迫的响应。转录组数据分析表明，玉米DUF1685基因与特定组织（成熟花粉）的生长发育相关。本研究从多方面探究了玉米DUF1685基因家族的功能和进化情况，以期为今后深入研究玉米DUF1685基因生物学功能和进化关系提供理论参考。
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| 关 键 词： | DUF1685基因 基因鉴定 进化分析 |
| 收稿时间： | 2022-04-24 |
Identification and Evolutionary Analysis of Maize DUF1685 Gene Family |
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| LUO Xuan,LIN Zhengyu,CHEN Zhang,LEI Bo,LI Jie,QUAN Jinying,LIU Hailan. Identification and Evolutionary Analysis of Maize DUF1685 Gene Family[J]. Chinese Journal of Tropical Crops, 2022, 43(12): 2431-2442. DOI: 10.3969/j.issn.1000-2561.2022.12.005 |
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| Authors: | LUO Xuan LIN Zhengyu CHEN Zhang LEI Bo LI Jie QUAN Jinying LIU Hailan |
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| Affiliation: | 1. Agricultural Information and Rural Economy Research Institute, Sichuan Academy of Agricultural Sciences, Chengdu, Sichuan 610066, China2. Maize Research Institute, Sichuan Agricultural University, Chengdu, Sichuan 611130, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | DUF1685 gene gene identification evolutionary analysis |
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