| 蓖麻RcWD40家族鉴定与表达分析 |
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| 引用本文： | 苟亚夫,唐杰松,于耸,郑志民. 蓖麻RcWD40家族鉴定与表达分析[J]. 中国油料作物学报, 2022, 44(2): 354. DOI: 10.19802/j.issn.1007-9084.2021041 |
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| 作者姓名： | 苟亚夫 唐杰松 于耸 郑志民 |
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| 作者单位： | 1.东北林业大学生命科学学院，东北盐碱植被恢复与重建教育部重点实验室，黑龙江 哈尔滨，1500402.东北林业大学林学院，林木遗传育种国家重点实验室，黑龙江 哈尔滨，150040 |
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| 基金项目： | 东北林业大学5211高层次人才引进科研启动基金(GCC2016-01) |
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| 摘 要： | 植物中的WD40蛋白家族通过蛋白质-蛋白质及蛋白质-DNA的互作，参与生物过程，该家族的重要成员TTG1在拟南芥中抑制种子脂肪酸的过早积累。为揭示油料作物蓖麻中RcWD40基因家族及RcTTG1基因的表达特征，利用生物信息学手段在全基因组水平鉴定到182个RcWD40家族成员，其中RcWD40-181为RcTTG1基因，并对它们的系统发育、保守结构域及表达模式等进行分析。根据进化树结构和保守域组成分别将RcWD40家族成员分为8个cluster和28个亚家族。此外，转录组分析显示RcWD40在蓖麻的花、叶、根、茎以及各发育时期种子中具有多样的表达模式，预测家族基因可能调节这些组织的生长发育。启动子区域转录因子结合位点及种子发育表达分析结果预测RcTTG1可能承担与AtTTG1相似的脂肪酸积累负调节功能。
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| 关 键 词： | 蓖麻 WD40蛋白 种子发育 表达模式 RcTTG1基因 |
| 收稿时间： | 2021-01-28 |
Genome-wide identification and expression of RcWD40 family in castor (Ricinus communis L.) |
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| Ya-fu GOU,Jie-song TANG,Song YU,Zhi-min ZHENG. Genome-wide identification and expression of RcWD40 family in castor (Ricinus communis L.)[J]. Chinese Journal of Oil Crop Sciences, 2022, 44(2): 354. DOI: 10.19802/j.issn.1007-9084.2021041 |
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| Authors: | Ya-fu GOU Jie-song TANG Song YU Zhi-min ZHENG |
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| Affiliation: | 1.Key Laboratory of Saline-alkali Vegetation Ecology Restoration, Ministry of Education, College of Life Science, Northeast Forestry University, Harbin 150040, China2.State Key Laboratory of Tree Genetics and Breeding, College of Forestry, Northeast Forestry University, Harbin 150040, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Ricinus communis L. WD40 proteins seed development expression pattern RcTTG1 gene |
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