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芒果MiAGL80基因特征及表达模式分析
引用本文:曾学梅,何新华,余海霞,黄星,陆婷婷,张艺粒,朱嘉伟,罗聪.芒果MiAGL80基因特征及表达模式分析[J].热带作物学报,2022,43(11):2243-2248.
作者姓名:曾学梅  何新华  余海霞  黄星  陆婷婷  张艺粒  朱嘉伟  罗聪
作者单位:广西大学农学院/亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室,广西南宁 530000
基金项目:国家现代农业产业技术体系广西芒果创新团队栽培与病虫害防治岗位项目(nycytxgxcxtd-2021-06-02);广西科技先锋队‘强农富民’‘六个一’专项行动项目(202204)
摘    要:AGL80/FEM111属于Type I型MADS-box基因家族,调控拟南芥中央细胞及胚乳的发育。目前,AGL80在木本植物中鲜有研究报道。本研究从芒果转录组数据中获得并命名为MiAGL80基因。生物信息学分析表明:MiAGL80基因位于1号染色体上,ORF全长为897 bp,无内含子,编码299个氨基酸,理论等电点为4.95,蛋白质分子量为73.19 kDa,氨基酸序列中含有1个MADS_SRF_like保守结构域。系统进化树分析表明:芒果MiAGL80与阿月浑子PvAGL80最为接近,且同源性最高,氨基酸相似性为64.29%。启动子序列分析显示:芒果MiAGL80基因的启动子包含光响应元件、逆境响应元件、转录因子结合位点以及激素响应元件等,其中光响应元件相较其他元件数量较多,不仅包含光调节相关元件,还包含昼夜节律表达所必需的区域元件;激素响应元件中包括赤霉素响应元件、生长素响应元件和乙烯响应元件;逆境响应元件主要是干旱响应元件。基因表达模式分析显示:在芒果果实中,MiAGL80随着芒果果实的逐渐发育,其在果肉中的表达水平持续下降,在花后100 d的果实与成熟果中的表达水平很低;在种胚发育过程中其表达水平先上升后下降,在花后100 d的胚和成熟胚中表达水平也很低;在种胚萌发发育期,其表达水平再次升高。在成花发育不同时期的组织器官中:MiAGL80主要在叶片中表达,其表达量先降低后逐渐升高,然后再降低,在花器官发育末期达到最大值;在花芽中的表达水平也显著高于营养芽;但在茎中表达量极低,几乎不表达。说明MiAGL80在芒果果实发育、种胚发育、种子萌发以及成花调控方面发挥作用。以上研究结果为深入研究MiAGL80基因的功能提供参考。

关 键 词:芒果  AGL80  基因特征  表达模式  
收稿时间:2022-01-19

Characterization and Expression Analysis of a MiAGL80 Gene in Mango
ZENG Xuemei,HE Xinhua,YU Haixia,HUANG Xing,LU Tingting,ZHANG Yili,ZHU Jiawei,LUO Cong.Characterization and Expression Analysis of a MiAGL80 Gene in Mango[J].Chinese Journal of Tropical Crops,2022,43(11):2243-2248.
Authors:ZENG Xuemei  HE Xinhua  YU Haixia  HUANG Xing  LU Tingting  ZHANG Yili  ZHU Jiawei  LUO Cong
Institution:College of Agriculture, Guangxi University / State Key Laboratory of Protection and Utilization of Subtropical Agricultural Biological Resources, Nanning, Guangxi 530000, China
Abstract:
Keywords:mango  AGL80  gene characterization  expression pattern  
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