| 油菜F-box-LRR基因全基因组鉴定与核盘菌诱导应答分析 |
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| 引用本文： | 左蓉,吴姗,刘杰,胡鸣,程晓晖,刘越英,白泽涛,刘胜毅. 油菜F-box-LRR基因全基因组鉴定与核盘菌诱导应答分析[J]. 中国油料作物学报, 2022, 44(3): 503. DOI: 10.19802/j.issn.1007-9084.2021121 |
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| 作者姓名： | 左蓉 吴姗 刘杰 胡鸣 程晓晖 刘越英 白泽涛 刘胜毅 |
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| 作者单位： | 中国农业科学院油料作物研究所，农业农村部油料作物生物学与遗传育种重点实验室，湖北 武汉，430062 |
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| 基金项目： | 中央级公益性科研院所基本科研业务费专项(Y2020YJ03);国家油菜产业技术体系(CARS-12) |
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| 摘 要： | 由核盘菌引起的菌核病是一种重要的真菌性病害，筛选菌核病抗病基因对抗病育种具有重要意义。F-box基因多参与植物抗逆反应，LRR作为抗病基因的重要结构域，在植物抗病防卫中起着重要的作用。本研究通过生物信息学方法在甘蓝型油菜基因组中对F-box-LRR基因进行了全基因组鉴定，基于已发表的中双11组织表达数据以及油菜不同品种中油821（抗病）和Westar（感病）接种核盘菌前后的转录组数据，对可能响应核盘菌诱导的BnF-box-LRR基因进行筛选，并结合荧光定量PCR进行验证。共鉴定到161个BnF-box-LRR基因，从系统进化树上可分为4个亚类（FBXLRR1，FBXLRR2，FBXLRR3和FBXLRR4），其中第四亚类FBXLRR4在蛋白保守序列分布以及基因结构方面，与其它三个亚类具有较大差异，且与拟南芥参与植物抗逆的同源基因聚为一类，因此推测该分支可能主要参与植物胁迫响应。表达分析表明FBXLRR4家族基因在根和叶中有较高的表达水平，且在核盘菌诱导后具有明显的表达变化，暗示这些基因可能参与油菜菌核病抗性功能。
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| 关 键 词： | 甘蓝型油菜 F-box-LRR基因家族 菌核病 基因表达 |
| 收稿时间： | 2021-04-21 |
Genome-wide characterization of F-box-LRR genes and their transcript response to Sclerotinia sclerotiorum induction in Brassica napus |
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| Rong ZUO,Shan WU,Jie LIU,Ming HU,Xiao-hui CHENG,Yue-ying LIU,Ze-tao BAI,Sheng-yi LIU. Genome-wide characterization of F-box-LRR genes and their transcript response to Sclerotinia sclerotiorum induction in Brassica napus[J]. Chinese Journal of Oil Crop Sciences, 2022, 44(3): 503. DOI: 10.19802/j.issn.1007-9084.2021121 |
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| Authors: | Rong ZUO Shan WU Jie LIU Ming HU Xiao-hui CHENG Yue-ying LIU Ze-tao BAI Sheng-yi LIU |
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| Affiliation: | Oil Crops Research Institute of Chinese Academy of Agriculture Sciences, Key Laboratory of Biology and Genetic Improvement of Oil Crops, Ministry of Agriculture and Rural Affairs, Wuhan 430062, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Brassica napus L. F-box-LRR gene family Sclerotinia stem rot gene expression |
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