| 龙脑樟法呢基焦磷酸合酶基因克隆及表达模式分析 |
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| 引用本文： | 杨琳,张杭颖,杨帆,朱泽榕,李秋妹,张君诚.龙脑樟法呢基焦磷酸合酶基因克隆及表达模式分析[J].热带作物学报,2022,43(10):1998-2005. |
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| 作者姓名： | 杨琳 张杭颖 杨帆 朱泽榕 李秋妹 张君诚 |
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| 作者单位： | 1.三明学院药用植物开发利用福建省高校工程研究中心,福建三明 3650042.福建农林大学食品科学学院,福建福州 350000 |
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| 基金项目： | 福建省科技厅面上项目(2020J01382);福建省教育厅中青年教师教育科研项目(JAT190703) |
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| 摘 要： | 法呢基焦磷酸合酶（farnesyl pyrophosphate synthetase,FPS）是萜类及其衍生物合成的关键限速酶。本研究以龙脑樟为材料,基于转录组测序,克隆CcFPS基因,利用生物信息学软件分析该基因编码的氨基酸序列特征,并采用实时荧光定量PCR（qPCR）检测CcFPS基因的表达,分析龙脑樟根、茎、叶中该基因的表达与总萜含量的关系。结果表明：CcFPS基因的开放阅读框为1053 bp,编码350个氨基酸,分子量为40.4 kDa,等电点pI为5.25,亲水性平均值（GRAVY）为-0.299。氨基酸同源性与沉水樟最高（98.86%）,含有7个相同的保守结构域和2个富含天冬氨酸的基序DDXX(XX)D]。二级结构α-螺旋、β-折叠、β-转角和无规则卷曲的比例分别为61.14%、6.57%、2.86%和29.43%,三级结构预测与沉水樟极其相似。系统发育树（NJ树）结果显示,CcFPS蛋白与同为樟科的沉水樟、山苍子的FPS处于同一个分支上。CcFPS基因在龙脑樟的根、茎、叶中均有表达,且表达具有组织特异性,在叶中的相对表达量最高,根中次之,茎中最低。在CcFPS蛋白调控的萜类物质代谢通路中,茎中的总萜含量最高,根中次之,叶中最低。龙脑樟FPS基因表达与总萜含量具有相关性,为进一步解析FPS基因在龙脑樟萜类化合物合成过程中的作用提供参考。
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| 关 键 词： | 龙脑樟 法呢基焦磷酸合酶（FPS） 基因表达 总萜 |
| 收稿时间： | 2021-12-16 |
Molecular Cloning and Expression of Farnesyl Pyrophosphate Synthetase in Cinnamomum camphora |
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| YANG Lin,ZHANG Hangying,YANG Fan,ZHU Zerong,LI Qiumei,ZHANG Juncheng.Molecular Cloning and Expression of Farnesyl Pyrophosphate Synthetase in Cinnamomum camphora[J].Chinese Journal of Tropical Crops,2022,43(10):1998-2005. |
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| Authors: | YANG Lin ZHANG Hangying YANG Fan ZHU Zerong LI Qiumei ZHANG Juncheng |
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| Institution: | 1. Fujian Provincial Medical Plant Exploitation and Utilization Engineering Research Center, Sanming University, Sanming, Fujian 365004, China2. School of Food Science, Fujian Agriculture and Forestry University, Fuzhou, Fujian 350000, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Cirmamonun camphora farnesyl pyrophosphate synthetase (FPS) gene expression total terpene |
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