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水稻干旱胁迫的small RNA转录组分析
引用本文:刘源,张秀妍,徐妙云,郑红艳,邹俊杰,张兰,王磊.水稻干旱胁迫的small RNA转录组分析[J].中国农业科技导报,2021,23(6):23-32.
作者姓名:刘源  张秀妍  徐妙云  郑红艳  邹俊杰  张兰  王磊
作者单位:中国农业科学院生物技术研究所, 北京 100081
基金项目:国家转基因生物新品种培育科技重大专项(2018ZX0801103B); 国家自然科学基金项目(31801283)
摘    要:small RNA在植物环境胁迫过程中起重要的调节作用。然而,参与干旱逆境响应复杂过程中的miRNAs及其调控机制仍有待于深入挖掘。对干旱胁迫处理不同时间的水稻根、茎和叶组织进行small RNA文库构建和转录组测序。所有样品共检测到403个miRNAs,其中已知miRNAs 352个,新预测miRNAs 51个。干旱处理后24 h的根、茎和叶中分别有37、35和56个差异表达miRNAs,而96 h的根、茎和叶中分别有35、62和65个差异表达miRNAs。15个miRNAs在干旱处理后两个时间点的根、茎和叶中均差异表达,其中,Osa-miR159f、Osa-miR164f、Osa-miR5082和Osa-miR5493受干旱诱导上调表达,是干旱响应中关键调控因子。预测到miRNAs靶基因4 537个,并进行了功能注释和富集分析。这些结果为鉴定干旱响应miRNAs并解析其参与抗旱的分子调控机理提供了理论和数据资源。

关 键 词:水稻  干旱胁迫  small  RNA  转录组  已知miRNA  新miRNA  靶基因  
收稿时间:2019-12-20
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