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固氮施氏假单胞菌(Pseudomonas stutzeri)A1501同化硝酸盐代谢基因簇分布及调控研究
引用本文:黄丽玲,李耘,王珊珊,陆超,杨智敏,林敏,燕永亮,陈明,张维,王劲,周正富,柯秀彬,战嵛华,陆伟.固氮施氏假单胞菌(Pseudomonas stutzeri)A1501同化硝酸盐代谢基因簇分布及调控研究[J].中国农业科技导报,2021,23(7):72-81.
作者姓名:黄丽玲  李耘  王珊珊  陆超  杨智敏  林敏  燕永亮  陈明  张维  王劲  周正富  柯秀彬  战嵛华  陆伟
作者单位:中国农业科学院生物技术研究所, 北京 100086
基金项目:国家自然科学基金项目(31930004,31770067); 中国农业科学院科技创新工程重大科研项目(CAAS-ZDRW202009)
摘    要:固氮施氏假单胞菌(Pseudomonas stutzeri)A1501在有氧条件下能够利用硝酸盐/亚硝酸盐为唯一氮源生长,表明该菌除了具有固氮和反硝化等氮循环系统外还有同化硝酸盐/亚硝酸盐系统。为进一步阐明该菌同化硝酸盐的代谢机制,利用生物信息学手段分析了硝酸盐同化相关基因的组成及分布情况,并初步研究了同化硝酸盐途径特异性调控关系。结果表明, P. stutzeri A1501中存在两个硝酸盐同化基因簇nasST-nasA-nirBDnasBcobA和nasR-nasFED,分布于基因组不同部位。第一个基因簇中nasS-nasT编码二元抗转录终止因子,nasA编码NarK/NasA家族硝酸盐转运蛋白,nirBD编码亚硝酸盐还原酶,nasB编码同化硝酸盐还原酶,cobA编码参与西罗血红素合成的尿卟啉-Ⅲ C-甲基转移酶;第二个基因簇中nasR编码单一组分抗转录终止因子,nasFED编码ABC型(ATP依赖)硝酸盐/亚硝酸盐转运蛋白。NasS-NasT双组分蛋白调控硝酸盐/亚硝酸盐还原酶基因的转录,NasR调控硝酸盐/亚硝酸盐转运蛋白基因的转录。

关 键 词:施氏假单胞菌A1501  硝酸盐同化  基因簇  途径特异性控制  
收稿时间:2021-04-19

Nitrate Assimilation Gene Distribution and Pathway-specific Regulation in Nitrogen-fixing Pseudomonas stutzeri A1501
HUANG Liling,LI Yun,WANG Shanshan,LU Chao,YANG Zhimin,LIN Min,YAN Yongliang,CHEN Ming,ZHANG Wei,WANG Jin,ZHOU Zhengfu,KE Xiubin,ZHAN Yuhua,LU Wei.Nitrate Assimilation Gene Distribution and Pathway-specific Regulation in Nitrogen-fixing Pseudomonas stutzeri A1501[J].Journal of Agricultural Science and Technology,2021,23(7):72-81.
Authors:HUANG Liling  LI Yun  WANG Shanshan  LU Chao  YANG Zhimin  LIN Min  YAN Yongliang  CHEN Ming  ZHANG Wei  WANG Jin  ZHOU Zhengfu  KE Xiubin  ZHAN Yuhua  LU Wei
Institution:Biotechnology Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing 100081, China
Abstract:
Keywords:Pseudomonas stutzeri A1501  nitrate assimilation  gene cluster  Pathway-specific control  
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