| 太岁DNA提取方法差异及对测知细菌结构的影响 |
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| 引用本文： | 王朝江,王世清,高春燕,李慧,李聪.太岁DNA提取方法差异及对测知细菌结构的影响[J].扬州大学学报(农业与生命科学版),2021,42(5):123-129. |
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| 作者姓名： | 王朝江 王世清 高春燕 李慧 李聪 |
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| 作者单位： | 河北省农林科学院经济作物研究所,石家庄050051 |
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| 摘 要： | 以太岁取样的加水热溶解为特点设计4种提取方法,将提取效果好的2个DNA样品用Illumina MiSeq高通量测序平台测序.结果 表明:滤膜法(SI3)和研磨法均可获得显示电泳条带的DNA,但前者能将太岁材料彻底破碎和滤除多糖;滤膜法样品测得优质序列46676条,聚类OTU 1095个,比研磨法多154个,只包含1个序列相对丰度大于1％的共有OTU,特有1个序列相对丰度41.14％的OTU,是研磨法的237倍,但滤膜法样品香农指数反比研磨法低1.37％,并导致两者菌群结构在各分类水平上有着明显差别.太岁DNA提取方法深刻影响细菌结构测定结果,滤膜法DNA菌群信息更真实,据其测知的优势结构为假单胞菌属(Pseudomonas)和不动杆菌属(Acinetobacter).
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| 关 键 词： | 太岁 DNA提取方法 细菌结构 高通量测序 |
Differences in Taisui DNA extraction methods and the effects on the result of bacterial structure |
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| WANG Chaojiang,WANG Shiqing,GAO Chunyan,LI Hui,LI Cong.Differences in Taisui DNA extraction methods and the effects on the result of bacterial structure[J].Journal of Yangzhou University:Agricultural and Life Science Edition,2021,42(5):123-129. |
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| Authors: | WANG Chaojiang WANG Shiqing GAO Chunyan LI Hui LI Cong |
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