茶树OSCA基因家族的鉴定及表达分析 |
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引用本文: | 刘丹丹,吴琼,焦小雨,孙明慧,王文杰.茶树OSCA基因家族的鉴定及表达分析[J].热带作物学报,2024(1):10-22. |
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作者姓名: | 刘丹丹 吴琼 焦小雨 孙明慧 王文杰 |
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作者单位: | 安徽省农业科学院茶叶研究所 |
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基金项目: | 安徽省重大专项(No.202003a06020021); |
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摘 要: | 钙通透性阳离子通道蛋白(OSCA)在植物调节高渗胁迫中发挥着重要作用。为了解OSCA基因家族在茶树响应干旱胁迫中的作用,本研究基于茶树全基因组数据对OSCA基因家族进行鉴定,分析CsOSCAs基因和蛋白结构以及启动子顺式作用元件,并对CsOSCAs在茶树不同组织、不同抗旱性品种间和干旱胁迫下的表达模式进行分析。结果表明:茶树基因组包含12个OSCA基因家族成员,分别命名为CsOSCA1~CsOSCA12;CsOSCAs基因编码的氨基酸序列长度为667~831 bp,蛋白分子量在76 630.55~93 563.99 kDa之间,等电点在6.15~9.33之间,含有9~12个跨膜结构域,均含有特征保守结构域DUF221,根据系统进化关系可以分为4个亚族;10个CsOSCAs基因定位于茶树7条染色体上,2个CsOSCAs基因定位于未锚定染色体的contig上;CsOSCAs基因编码的蛋白二级结构含有32%~38%的跨膜结构和60%~68%的α-螺旋;CsOSCAs基因具有组织表达特异性,CsOSCA2、CsOSCA3、CsOSCA11、CsOSCA12基因在干旱敏感的品种CN98中的表达量...
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关 键 词: | 茶树 OSCA基因家族 Ca2+通道 全基因组表达分析 |
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