湖羊lncRNA-269的鉴定及转录调控分析 |
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引用本文: | 舒嘉傲,曹少先,孟春花,钱勇,张俊,张建丽,丁强,李隐侠,李齐发.湖羊lncRNA-269的鉴定及转录调控分析[J].南京农业大学学报,2024(1):174-182. |
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作者姓名: | 舒嘉傲 曹少先 孟春花 钱勇 张俊 张建丽 丁强 李隐侠 李齐发 |
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作者单位: | 1. 南京农业大学动物科技学院;2. 江苏省农业科学院畜牧研究所 |
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基金项目: | 国家自然科学基金项目(32102550); |
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摘 要: | 目的]本文旨在研究湖羊长链非编码RNA-269(long no-coding RNA-269,lncRNA-269)序列特征、表达模式和转录调控,为后续开展lncRNA-269的功能研究提供理论基础。方法]以湖羊为研究对象,采用5′/3′RACE结合PCR扩增方法获得其序列全长,利用RT-qPCR方法鉴定其在湖羊组织中的表达模式,并利用PCR方法扩增其启动子区,鉴定其启动子区特征,分析其转录调控情况。结果]湖羊lncRNA-269全长3 146 bp,组织表达谱显示其在湖羊各组织中广泛表达,且在健康卵泡中显著高表达,其表达水平与NR5A1 mRNA水平和血清中雌二醇(E2)水平呈正相关。荧光素酶活性分析发现在lncRNA-269启动子区的-359~-17 nt有1个转录激活基序,在-1 485~-942 nt有1个转录抑制基序。JASPAR软件预测发现在lncRNA-269转录抑制启动子区域存在FOXO3、PDX1等转录因子结合位点,在转录激活区域有SMAD4、YY1等转录因子结合位点。过表达SMAD4可显著提升lncRNA-269启动子区荧光素酶活性,染色...
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关 键 词: | 湖羊 卵巢卵泡 lncRNA-269 5′/3′RACE 染色质免疫沉淀(ChIP) |
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