BSA联合转录组分析发掘西瓜叶片黄化候选基因 |
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引用本文: | 张朝阳,程瑞,徐兵划,顾妍,黄大跃,孙玉东.BSA联合转录组分析发掘西瓜叶片黄化候选基因[J].江苏农业学报,2024(1):165-173. |
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作者姓名: | 张朝阳 程瑞 徐兵划 顾妍 黄大跃 孙玉东 |
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作者单位: | 江苏徐淮地区淮阴农业科学研究所/淮安市设施蔬菜重点实验室 |
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基金项目: | 国家西甜瓜产业技术体系淮安综合试验站项目(CARS-25); |
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摘 要: | 叶片是植物重要的功能器官之一,不仅是植株进行光合作用的主要场所,也可作为重要的形态标记,应用于育种中。叶片颜色作为形态标记,不仅可用于苗期杂种的清除,亦可用于种子纯度的测定。以西瓜全生育期叶片黄化突变体纯合自交系ly104为母本(P1)、绿叶自交系w3为父本(P2),通过杂交创制F1代、F2代、BC1代群体。遗传分析结果表明,该突变体的叶片黄化由单隐性基因控制。采用混合分组分析(BSA)进行初定位,通过简化基因组测序(RAD)开发全基因组单核苷酸多态性(SNP)标记构建西瓜高密度遗传图谱,将西瓜叶片黄化基因定位于2号染色体13 950 306~15 517 591 bp(大小约为1.57 Mb)。以西瓜97103v2为参考基因组,该区间包含24个注释基因。对P1(P1Y)、P2(P2G)和F2代群体中黄叶(F2Y)、绿叶(F2G)株系进行转录组水平分析,结果表明,目标区间内基因Cla97C02G035950、Cl...
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关 键 词: | 西瓜 黄化 BSA 遗传图谱 基因定位 |
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