甘薯PEBP基因家族鉴定以及影响甘薯块根发育候选PEBP基因的鉴定 |
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引用本文: | 黄哲瑞,辛曙丽,赵添,刘永华,朱国鹏.甘薯PEBP基因家族鉴定以及影响甘薯块根发育候选PEBP基因的鉴定[J].热带作物学报,2024(3):459-472. |
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作者姓名: | 黄哲瑞 辛曙丽 赵添 刘永华 朱国鹏 |
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作者单位: | 1. 海南大学三亚南繁研究院;2. 海南大学园艺学院/海南省热带园艺作物品质调控重点实验室;3. 保亭黎族苗族自治县农业服务中心 |
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基金项目: | 海南省自然科学基金项目(No.320RC476);;海南省基础与应用基础研究计划(自然科学领域)高层次人才项目(No.2019RC146);;国家自然科学基金项目(No.32260440); |
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摘 要: | 磷脂酰乙醇胺结合蛋白(PEBP)在植物中广泛存在,在调控开花、种子休眠以及地下储藏器官(如马铃薯块茎和洋葱鳞茎)形成中发挥着重要作用。但目前有关甘薯(Ipomoea batatas)PEBP基因家族成员的研究较少,且尚未有研究系统揭示调控甘薯块根发育的关键PEBP家族成员。本研究首先通过生物信息学分析对甘薯基因组中PEBP基因家族成员的数量和种类进行鉴定,然后通过PEBP基因表达的组织特异性分析、PEBP基因在不同发育时期块根中表达水平的动态变化及其与糖转运蛋白SWEET基因表达水平之间的相关性分析,系统筛选出调控甘薯块根发育的候选PEBP基因家族成员并初步揭示其可能的调控机制。结果如下:(1)从甘薯基因组中共鉴定出15个PEBP基因,聚类分析将其分为4个亚家族:5个FT-like成员(IbFT1~5)、6个TFL1-like成员(IbTFL1~6)、2个MFT-like成员(IbMFT1~2)和2个PEBP-like成员(IbPEBP1~2)。(2)聚类分析结果表明,IbFT5可能会促进甘薯块根发育,而IbTFL3可能会抑制其块根发育。(3)甘薯PEBP基因表达的组织特异性分析表明,...
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关 键 词: | 甘薯 PEBP基因家族 生物信息学 组织表达特异性 块根发育 |
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