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石榴MAPK家族基因鉴定及其响应冷胁迫的表达分析
引用本文:陈利娜,曹尚银,唐丽颖,李好先,严琼,李松开,杨庆华,鲁振华.石榴MAPK家族基因鉴定及其响应冷胁迫的表达分析[J].果树学报,2023(10):2076-2088.
作者姓名:陈利娜  曹尚银  唐丽颖  李好先  严琼  李松开  杨庆华  鲁振华
作者单位:1. 中国农业科学院郑州果树研究所;2. 河北省承德市农林科学院;3. 蒙自市果蔬技术推广站
基金项目:国家重点研发计划项目(2021YFD1600802);;中国农业科学院科技创新工程(CAAS-ASTIP-2023-ZFRI);;河南省科技攻关项目(212102110421);
摘    要:【目的】评价不同石榴种质资源籽粒硬度及抗寒性,筛选可能参与调控石榴抗寒性的MAPK家族基因。【方法】以31份石榴种质资源为试材,进行抗寒性及籽粒硬度评价;基于全基因组筛选石榴MAPK家族基因,对其进行进化、基因结构和蛋白理化性质分析,同时利用实时荧光定量PCR(real-time quantitative PCR,qRT-PCR)分析冷胁迫对石榴MAPK家族基因表达模式的影响。【结果】31个石榴品种籽粒硬度及半致死温度测定结果表明,峄城粉红牡丹、淮北六棱甜和鲁白榴2号等硬籽石榴抗寒性较强,华紫、以3和玛丽斯等软籽石榴抗寒性较弱。基于石榴全基因组鉴定出17个MAPK家族基因,广泛分布于8条染色体上;MAPK家族所有成员主要分为3个亚类,其中,A和B亚类成员主要包含PKc_MAPKK_plant_like和PTZ00024结构域,C亚类主要包含PLN00034结构域,所有成员均具有S_TKc结构域;各成员氨基酸残基数量分布在314~860 aa,外显子数目1~18个,蛋白分子质量为34 910.05~97 965.26 u,等电点4.94~9.35;PgMKK2、PgMPK6、PgMPK9...

关 键 词:石榴  籽粒硬度  抗寒性  MAPK  表达分析
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