| 苜蓿乙烯应答因子基因的表达特性和生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 陈婷婷,杨青川,张新全,康俊梅,丁旺,张铁军. 苜蓿乙烯应答因子基因的表达特性和生物信息学分析[J]. 草业学报, 2012, 21(6): 166-174. DOI: 10.11686/cyxb20120622 |
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| 作者姓名： | 陈婷婷 杨青川 张新全 康俊梅 丁旺 张铁军 |
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| 作者单位： | 1.中国农业科学院北京畜牧兽医研究所,北京 100193;2.四川农业大学草业科学系,四川 雅安 625014 |
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| 基金项目： | 国家现代牧草产业技术体系，国家自然科学基金 |
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| 摘 要： | 乙烯应答因子(ethylene response factor,ERF)是植物特有的一类转录因子,参与植物生长发育和胁迫应答等多个生理生化过程。本研究以拟南芥AP2结构域为探针搜索美国国立生物技术信息中心(NCBI)的苜蓿属蛋白质数据库,运用生物信息学软件分析苜蓿乙烯应答因子的系统进化、疏水轮廓、二级结构、信号肽以及亚细胞定位情况。运用半定量RT-PCR技术研究5个紫花苜蓿乙烯应答因子基因(MsERF1, MsERF2,MsERF6, MsERF7, MsERF9)表达的组织差异性以及多种处理条件下的表达特性。结果表明,5个乙烯应答因子基因在叶中的表达量都明显高于其他组织,不同基因有不同的组织表达特性;NaCl和PEG6000对MsERF2的表达没有影响,但Al2(SO4)3能诱导其表达,其余基因的表达都受这3种处理的诱导;脱落酸对MsERF2的表达没有影响,能够诱导其他基因的表达;生长素只能诱导MsERF6的表达,对其他基因的表达没有影响;赤霉素、茉莉酸甲酯和乙烯利对5个基因的表达都起促进作用。本研究为进一步研究苜蓿乙烯应答因子的结构和功能奠定了基础,同时为研究不同信号传导途径之间的相互作用提供了依据。
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| 关 键 词： | 紫花苜蓿 乙烯应答因子 生物信息学分析 半定量RT-PCR 表达分析 |
| 收稿时间： | 2011-11-15 |
Bioinformatics and expression analyses of ethylene response factor genes in Medicago |
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| CHEN Ting-ting , YANG Qing-chuan , ZHANG Xin-quan , KANG Jun-mei , DING Wang , ZHANG Tie-jun. Bioinformatics and expression analyses of ethylene response factor genes in Medicago[J]. Acta Prataculturae Sinica, 2012, 21(6): 166-174. DOI: 10.11686/cyxb20120622 |
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| Authors: | CHEN Ting-ting YANG Qing-chuan ZHANG Xin-quan KANG Jun-mei DING Wang ZHANG Tie-jun |
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| Affiliation: | 1.Institute of Animal Science, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing 100193, China;2.Department of Grassland Science, Sichuan Agricultural University, Ya’an 625014, China |
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| Abstract: | |
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