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2种枇杷属植物的trnH-psbA条形码序列变异及其近缘属系统发育初步研究
引用本文:胡文舜,蒋际谋,黄爱萍,许奇志,陈秀萍,郑少泉.2种枇杷属植物的trnH-psbA条形码序列变异及其近缘属系统发育初步研究[J].热带作物学报,2014,35(1):12-16.
作者姓名:胡文舜  蒋际谋  黄爱萍  许奇志  陈秀萍  郑少泉
作者单位:1 福建省农业科学院果树研究所 2 福建省龙眼枇杷育种工程技术研究中心;1 福建省农业科学院果树研究所 2 福建省龙眼枇杷育种工程技术研究中心;2 福建省龙眼枇杷育种工程技术研究中心3 福建省农业科学院农业经济与科技信息研究所;1 福建省农业科学院果树研究所 2 福建省龙眼枇杷育种工程技术研究中心;1 福建省农业科学院果树研究所 2 福建省龙眼枇杷育种工程技术研究中心;1 福建省农业科学院果树研究所 2 福建省龙眼枇杷育种工程技术研究中心
基金项目:福建省自然科学基金项目(No. 2011J01099);农业部农业科研杰出人才及其创新团队;公益性行业(农业)科研专项经费项目(No. 201003073);农业部作物种质资源保护项目(No. NB2130135);农业部热带作物种质资源保护项目(No. 13RZZY-15)。
摘    要:选用枇杷野生近缘种‘栎叶枇杷’和栽培种‘早钟6号’、‘香妃’,对其叶绿体基因组trnH-psbA基因间隔区进行PCR克隆与测序,利用生物信息学方法分析其序列特征,并构建苹果亚科内19个属的系统发育树。结果表明:trnH-psbA序列长323~392 bp(GenBank登录号:KF022254、KF022255、KF022256),G+C含量30.10%~33.13%,共有1个核苷酸替换(substitution)和2个插入/缺失(indel);基于trnH-psbA DNA条形码序列的分子系统进化分析结果表明,苹果亚科内形成2个大的分支,枇杷属与石斑木属的亲缘关系最近(平均遗传距离为0.055)。此结果表明叶绿体基因trnH-psbA序列可有效地进行枇杷属内物种鉴别及属间分类,是枇杷属植物DNA条形码研究的标准基因之一。

关 键 词:枇杷属  trnH-psbA  DNA条形码  序列分析  系统进化

Sequence Variation of trnH-psbA Barcode in Two Eriobotrya Plants and Phylogenetic Relationships with Related Genera
HU Wenshun,JIANG Jimou,HUANG Aiping,XU Qizhi,CHEN Xiuping and ZHENG Shaoquan.Sequence Variation of trnH-psbA Barcode in Two Eriobotrya Plants and Phylogenetic Relationships with Related Genera[J].Chinese Journal of Tropical Crops,2014,35(1):12-16.
Authors:HU Wenshun  JIANG Jimou  HUANG Aiping  XU Qizhi  CHEN Xiuping and ZHENG Shaoquan
Abstract:
Keywords:
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