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| 基于PEG胁迫表达谱发掘调控谷子干旱胁迫的泛素连接酶E3基因 | |
| 作者单位： | ;1.山西农业大学农学院;2.特色杂粮种质资源发掘与育种改良山西省重点实验室;3.山西农业大学农业生物工程研究所;4.农业部黄土高原作物基因资源与种质创制重点实验室 |
| 摘 要： | 目的]探析谷子调控干旱胁迫的E3基因。方法]本文基于二代测序技术获得勾勾母鸡咀(GG)和晋汾16(JF)在PEG胁迫下的转录表达谱数据,运用生物信息学检索筛选出11个干旱相关的E3基因,对其理化性质、功能域、启动子元件、表达模式以及与其它物种E3基因的系统进化分析。结果]蛋白等电点介于4.78~8.88之间,功能域主要为ZF_UBR型、ZF_RING和U_BOX型三类,启动子序列包含干旱诱导响应元件MBS或脱落酸响应元件ABRE等,其中Si001665m和Si022170m与PUB22/23亲缘关系较近,Si029090m与PUB19亲缘关系较近。结论]初步确定这些是调控谷子干旱胁迫的E3候选基因,可能受干旱或脱落酸诱导表达,这为进一步研究谷子干旱响应相关的泛素连接酶E3基因提供理论依据。 |
| 关 键 词： | 谷子 泛素连接酶E3 干旱胁迫 表达谱 |
Ubiquitin ligase E3 genes mining based on expression profiles under PEG stress in foxtail millet |
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