| 系统发生分析软件PAUP和TreePuzzle使用方法介绍 |
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| 引用本文： | 王勇,陈克平,姚勤.系统发生分析软件PAUP和TreePuzzle使用方法介绍[J].安徽农业科学,2008,36(2):818-821,829. |
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| 作者姓名： | 王勇 陈克平 姚勤 |
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| 作者单位： | 1. 江苏大学食品与生物工程学院,江苏镇江,212013
2. 江苏大学生命科学研究院,江苏镇江,212013 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金资助项目(30370773) |
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| 摘 要： | 系统发生分析被广泛应用于研究不同生物DNA、蛋白质序列的进化关系。PAUP和TreePuzzle是目前使用较多的系统发生分析软件,但其使用方法较为复杂,不易被初学者掌握。从序列信息模块、序列参数模块、运算命令模块3个方面介绍了PAUP软件的使用方法,同时也对TreePuzzle软件的使用和进化树的编辑与注释方法做了简单介绍。
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| 关 键 词： | 系统发生分析 PAUP TreePuzzle |
| 文章编号： | 0517-6611（2008）02-00818-04 |
| 收稿时间： | 2007-09-03 |
| 修稿时间： | 2007年9月3日 |
Introduction to Usage of Phylogenetic Analysis Softwares PAUP and TreePuzzle |
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| WANG Yong et al.Introduction to Usage of Phylogenetic Analysis Softwares PAUP and TreePuzzle[J].Journal of Anhui Agricultural Sciences,2008,36(2):818-821,829. |
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| Authors: | WANG Yong |
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| Abstract: | Phylogenetic analysis has been used to study the evolutionary relationship among DNA and protein sequences of various organisms extensively. PAUP and TreePuzzle are such softwares that have been used frequently in recent years. However, the steps to use them are fairly complicated, bringing much difficulty to the beginners. The introduction to usage of PAUP is provided from some aspects, such as the sequence information module, the sequence parameter module, the operation command module. Besides, a brief introduction is made on the usage and the annotation to phylogenetic trees of TreePuzzle. |
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| Keywords: | Phylogenetic analysis PAUP TreePuzzle |
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