| 基于中国樱桃转录组的SSR分子标记开发与鉴定 |
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| 引用本文： | 宗宇,王月,朱友银,邵妁,李永强,郭卫东. 基于中国樱桃转录组的SSR分子标记开发与鉴定[J]. 园艺学报, 2016, 43(8): 1566-1576. DOI: 10.16420/j.issn.0513-353x.2016-0005 |
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| 作者姓名： | 宗宇 王月 朱友银 邵妁 李永强 郭卫东 |
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| 作者单位： | （浙江师范大学化学与生命科学学院，浙江省特色经济植物生物技术研究重点实验室，浙江金华 321004；金华职业技术学院农业与生物工程学院，浙江金华 321007） |
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| 基金项目： | 浙江省自然科学基金项目(LQ15C150001)，浙江省科技厅果品新品种选育重大专项(2012C12904-6)，浙江师范大学博士基金科研项目 |
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| 摘 要： | 对中国樱桃(Prunus pseudocerasus Lindl.)休眠芽转录组数据进行了SSR位点搜索和分析,发现了7 197个SSR位点,总的发生频率为15.62%。SSR重复类型以二核苷酸发生频率最高(58.65%),三核苷酸次之(34.72%)。利用8对多态性引物在24份樱桃种质中进行了引物有效性验证和遗传多样性分析,结果表明有效等位基因数最大值为2.92(Pp SSR2),最小值为1.09(Pp SSR8),平均值为1.73;香农多样性指数变化范围是0.202~1.290,平均值为0.755。观察杂合度和期望杂合度的变化范围分别是0.083~0.917和0.082~0.671;平均值分别为0.391和0.384。香农多样性指数、观察杂合度和期望杂合度3个多样性指数最大值均出现在位点Pp SSR2,最小值出现在位点Pp SSR8。基于SSR标记的24份樱桃种质的聚类结果与经典的形态学分类不完全一致,但聚类结果清晰地划分出5个不同组别,说明浙江省的中国樱桃种质资源遗传多样性丰富。两个龙泉地方品种与其他的浙江樱桃种质资源明显不同,它们与山樱和浙闽樱有着更紧密的遗传关系,该地方品种可以作为樱桃新品种选育的优良材料,有利于拓宽现有樱桃栽培品种的遗传背景。
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| 关 键 词： | 中国樱桃 转录组 SSR 种质资源 遗传多样性 |
Development and Validation of SSR Markers Based on Transcriptomic Data of Chinese Cherry (Prunus pseudocerasus) |
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| ZONG Yu,WANG Yue,ZHU You-yin,SHAO Xu,LI Yong-qiang,GUO Wei-dong. Development and Validation of SSR Markers Based on Transcriptomic Data of Chinese Cherry (Prunus pseudocerasus)[J]. Acta Horticulturae Sinica, 2016, 43(8): 1566-1576. DOI: 10.16420/j.issn.0513-353x.2016-0005 |
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| Authors: | ZONG Yu WANG Yue ZHU You-yin SHAO Xu LI Yong-qiang GUO Wei-dong |
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| Affiliation: | （Zhejiang Provincial Key Laboratory of Biotechnology on Specialty Economic Plants，College of Chemistry and Life Sciences，Zhejiang Normal University，Jinhua，Zhejiang 321004，China；College of Agricultural and Biological Engineering，Jinhua Polytechnic，Jinhua，Zhejiang 321007，China） |
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