陕西省小麦禾谷孢囊线虫rDNA-ITS区序列与RFLP分析

 采用线虫通用引物TW81和AB28对采自陕西的20个小麦禾谷孢囊线虫群体的rDNA-ITS区进行PCR扩增、克隆和测序。利用Mega软件的UPGMA方法分析了陕西省小麦禾谷孢囊线虫群体及其与GenBank公布的近缘种的系统发育关系，结果表明陕西省小麦孢囊线虫群体的rDNA-ITS区片段的长度为1 045 bp，且均为禾谷孢囊线虫（Heterodera avenae），ITS区序列同源性为99.56%，只有3处碱基存在差异。其ITS区同中国河南（EU106175）、北京（AY148382）、山东（HM370427）的禾谷孢囊线虫H. avenae，澳大利亚的H. australis（AY148395）及俄罗斯的H. pratensis（AY148351）的亲缘关系最为接近。利用8种限制性内切酶Ava Ⅰ（Eco88 Ⅰ）、Alu Ⅰ、Hha Ⅰ（Cfo Ⅰ）、Hae Ⅲ（BsuR Ⅰ）、Hind Ⅲ、Hinf Ⅰ、Rsa Ⅰ和Mva Ⅰ（Bst N1）对20个陕西省CCN群体的ITS区PCR扩增产物进行限制性内切酶谱（RFLP）分析，结果表明8种限制性内切酶酶切ITS-PCR产物后共产生22个酶切片段，20个种群的PCR-RFLP谱型一致，表明陕西省小麦禾谷孢囊线虫是同一个群体且与已报道的中国CCN群体的“C”型一致，有别于欧洲的“A”型群体和印度的“B”型群体。这是首次报道陕西省小麦禾谷孢囊线虫种群的分子特征。

Sequence and RFLP analysis of rDNA-ITS region of cereal cyst nematode on wheat from Shaanxi Province

The amplification of rDNA-ITS region of Heterodera avenae(CCN) populations collected from twenty counties of Shaanxi Province with the universal primers TW81 and AB28 produced a single fragment of 1 045 base pairs.The results of ITS sequence analysis and multi-alignment among Shaanxi CCN populations and its related species including Chinese CCN populations(GenBank accession number EU106175 for Henan population,AY148382 for Beijing population and HM370427 for Shandong population),Australian population(AY1483...