| 响应面法优化海洋沉积物微生物总DNA提取方法 |
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| 引用本文： | 郭瑞,赵新强,于翠芳,张名爱,程凡升.响应面法优化海洋沉积物微生物总DNA提取方法[J].青岛农业大学学报(自然科学版),2016(3). |
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| 作者姓名： | 郭瑞 赵新强 于翠芳 张名爱 程凡升 |
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| 作者单位： | 青岛农业大学食品科学与工程学院,山东青岛,266109 |
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| 基金项目： | 国家自然基金(31301438)，山东省优秀中青年科学家奖励基金(BS2013SW034) |
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| 摘 要： | 海洋沉积物中的微生物是自然界生态系统中不可或缺的组分,在维持环境与海洋生态平衡方面发挥着重要作用.在海洋沉积物微生物的研究中,细胞裂解率低、片段不够完整等问题导致无法高效地提取微生物的总DNA片段.本实验采用响应面分析法对CTAB-SDS-冻融DNA提取法进行优化.根据单因素的实验结果,选取溶菌酶含量、65℃水浴时间、蛋白酶K含量作为影响因子,利用Box-Behnken进行实验设计,将DNA浓度作为响应值,进行DNA提取方法的响应面优化实验.结果发现:当溶菌酶含量为1.13 mg/mL、65℃水浴时间为100 min、蛋白酶K含量为0.21 mg/mL时,DNA提取效果达到最好.验证实验表明:优化后提取DNA的实际值与理论值相近,具有可行性,优化后提取的DNA片段在纯度、浓度方面高于优化之前.
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| 关 键 词： | 响应面法 海洋沉积物微生物 DNA提取 |
Optimization of a Marine Sediment Microbial Total DNA Extraction Methods by Response Surface Methodology |
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| Keywords: | response surface methodology marine sediment microorganisms DNA extraction |
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