EHV-1皮层蛋白VP22生物信息学分析及亚细胞定位研究

为了研究马疱疹病毒(EHV-1)皮层蛋白VP22的生物学功能,试验通过克隆测序获得VP22基因并构建系统进化树,采用生物信息学软件分析其生物学特征,并将其编码基因的PCR扩增产物亚克隆至p DsRed2-N1真核表达载体,构建重组质粒pDsRed-VP22,研究VP22在BHK-21细胞中定位。结果表明:EHV-1新疆本地株的VP22由304个氨基酸组成,其序列与欧洲分离株Ab4的同源性为100%,与其他分离株的同源性为97%~99%; VP22是一种无信号肽、跨膜区及核定位信号(NLS)的磷酸化蛋白质,具有1个核输出信号(NES)序列及14个蛋白结合位点; VP22的二级结构主要由α-螺旋及β-折叠构成,三级结构及表面电荷分布情况显示该蛋白质正反两面的电荷分布差异较大;生物学功能预测显示EHV-1 VPP22是一种多功能蛋白质;此外,试验成功构建出重组质粒p DsRed-VP22,并证实EHV-1 VP22定位于BHK-21细胞的内质网-高尔基体(ER-Golgi)膜系附近。