基于QTL定位和全基因组关联分析挖掘甘蓝型油菜收获指数相关位点 |
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引用本文: | 张超,杨博,张立源,肖忠春,刘景森,马晋齐,卢坤,李加纳.基于QTL定位和全基因组关联分析挖掘甘蓝型油菜收获指数相关位点[J].作物学报,2022(9):2180-2195. |
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作者姓名: | 张超 杨博 张立源 肖忠春 刘景森 马晋齐 卢坤 李加纳 |
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作者单位: | 1. 西南大学农学与生物科技学院;2. 西南大学现代农业科学研究院;3. 贵州省农业科学院贵州省油料研究所 |
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基金项目: | 国家重点研发计划项目(2018YFD0100500);;国家自然科学基金项目(31830067,31871653);;高等学校学科创新引智基地项目“111”工程项目(B12006); |
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摘 要: | 收获指数是一个重要的农艺性状,甘蓝型油菜的收获指数偏低,有较大的改良空间,研究油菜收获指数的遗传机理对该性状的改良具有重要的指导意义。本研究利用已构建的高密度遗传图谱对由高、低收获指数亲本衍生而来的包含186个株系的重组自交系进行收获指数的数量性状位点(quantitative trait locus, QTL)定位, 2016—2018连续3年环境及最佳线性无偏预测(best linear unbiased prediction, BLUP)值共定位到12个收获指数相关QTL,分别位于A03、A05、A06、A07、A09、C04和C05_random染色体上,单个QTL解释的表型变异在1.27%~14.20%之间。同时,利用588份重测序自然群体对收获指数性状开展了全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS),2016、2017、2019年及BLUP值共检测到6个显著关联位点,分别位于A09、C01和C03染色体上,其中2019年环境检测到的位于A09上的S9_25882060与S9_25961704重叠,且与2016年环境检测到的位于A...
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关 键 词: | 甘蓝型油菜 收获指数 全基因组关联分析 候选基因 |
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