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甘薯解偶联蛋白基因家族鉴定与表达分析
作者姓名:陈璐  周淑倩  李永新  陈刚  陆国权  杨虎清
作者单位:浙江农林大学食品与健康学院
基金项目:国家自然科学基金项目(31871857);;财政部和农业农村部国家现代农业产业技术体系建设专项(CARS-10-B19);;浙江省自然科学基金项目(LQ20C200002)资助~~;
摘    要:本研究旨在鉴定和分析甘薯(Ipomonea batatas (L.) Lam)解偶联蛋白(uncoupling protein, UCPs)基因家族成员,探究其在甘薯不同组织中的表达特异性及其对低温(4℃)、高盐(NaCl)和干旱(PEG-6000)等胁迫的响应规律。结果发现,甘薯UCP(IbUCP)含有5个家族基因,分别将其命名为IbUCP1(GenBank登录号为MW753000)、IbUCP2(GenBank登录号为MW753004)、IbUCP3 (GenBank登录号为MW753001)、IbUCP4 (GenBank登录号为MW753002)和IbUCP5 (GenBank登录号为MW753003)。预测IbUCP的理论等电点为8.53~9.86,含有261~375个的氨基酸残基;IbUCP定位于线粒体; IbUCP为亲水蛋白,又属于线粒体载体蛋白超家族的成员,其二级结构主要包括α-螺旋和无规则卷曲,这与三级结构预测结果相符;IbUCP不存在跨膜螺旋结构和信号肽;IbUCP家族成员分为5个,与三裂叶薯和牵牛花有较近的亲缘关系,具有一定的保守性;启动子预测发现,IbUCPs基...

关 键 词:甘薯  解偶联蛋白  生物信息学  表达分析  胁迫
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