| 谷子Ⅲ型PRX基因家族全基因组鉴定及干旱胁迫下表达分析 |
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| 引用本文： | 马鑫磊,许瑞琪,索晓曼,李婧实,顾鹏鹏,姚锐,林小虎,高慧.谷子Ⅲ型PRX基因家族全基因组鉴定及干旱胁迫下表达分析[J].作物学报,2022(10):2517-2532. |
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| 作者姓名： | 马鑫磊 许瑞琪 索晓曼 李婧实 顾鹏鹏 姚锐 林小虎 高慧 |
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| 作者单位： | 1. 河北省作物逆境生物学重点实验室;2. 河北科技师范学院农学与生物科技学院 |
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| 基金项目： | 国家“十三五”重点研发计划项目(2019YFD1001701-2)；;河北省自然科学基金项目(C2019407089)；;河北省高等学校科学技术研究项目(QN2020154)； |
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| 摘 要： | Ⅲ型过氧化物酶(Class Ⅲ peroxidase, PRX)是植物中特有的过氧化物酶家族,在植物生长发育以及非生物胁迫中发挥重要作用。谷子作为C4植物是禾本科抗逆研究的模式植物,然而目前对于谷子中Ⅲ型过氧化物酶家族基因功能鲜有报道。为探究谷子Ⅲ型过氧化物酶基因家族(SitPRXs)在干旱胁迫和ABA诱导下的表达模式,进行了全基因组表达分析。本研究利用生物信息学方法在谷子全基因组中鉴定出132个Ⅲ型PRX基因家族成员,并根据其在染色体上位置顺序依次命名为SitPRX1～SitPRX132。通过对谷子、拟南芥和水稻的系统进化分析将其分为5个亚家族,基因结构和保守基序分析表明同一亚家族具有较高的保守性。基因复制分析显示, 17个SitPRX基因(13%)存在片段复制,78个SitPRX基因(59%)存在串联复制,串联复制事件在SitPRX基因扩增中起重要作用。谷子与拟南芥、水稻和玉米的物种间同源性分析显示谷子中大多数SitPRXs是在双子叶植物和单子叶植物分化后形成的。转录组分析显示, SitPRX基因家族成员在谷子幼苗、根、茎、叶以及圆锥花序中表达存在差异。启动子顺式作用元件分析显示,...
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| 关 键 词： | Ⅲ型过氧化物酶 基因家族分析 干旱胁迫响应 谷子 |
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