云南糯玉米地方品种糯性等位基因wx-xuanwei的分子特征 |
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引用本文: | 武晓阳,隆文杰,陈丹,周国雁,杜娟,伍少云,蔡青.云南糯玉米地方品种糯性等位基因wx-xuanwei的分子特征[J].江西农业学报,2020,32(3):35-41. |
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作者姓名: | 武晓阳 隆文杰 陈丹 周国雁 杜娟 伍少云 蔡青 |
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作者单位: | 云南省农业科学院 生物技术与种质资源研究所/云南省农业生物技术重点实验室/农业农村部 西南作物基因资源与种质创制重点实验室,云南 昆明 650223;云南省农业科学院 生物技术与种质资源研究所/云南省农业生物技术重点实验室/农业农村部 西南作物基因资源与种质创制重点实验室,云南 昆明 650223;云南省农业科学院 生物技术与种质资源研究所/云南省农业生物技术重点实验室/农业农村部 西南作物基因资源与种质创制重点实验室,云南 昆明 650223;云南省农业科学院 生物技术与种质资源研究所/云南省农业生物技术重点实验室/农业农村部 西南作物基因资源与种质创制重点实验室,云南 昆明 650223;云南省农业科学院 生物技术与种质资源研究所/云南省农业生物技术重点实验室/农业农村部 西南作物基因资源与种质创制重点实验室,云南 昆明 650223;云南省农业科学院 生物技术与种质资源研究所/云南省农业生物技术重点实验室/农业农村部 西南作物基因资源与种质创制重点实验室,云南 昆明 650223;云南省农业科学院 生物技术与种质资源研究所/云南省农业生物技术重点实验室/农业农村部 西南作物基因资源与种质创制重点实验室,云南 昆明 650223 |
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基金项目: | 云南省博士后定向资助基金[云人社通(2018)168号;科技部、财政部国家科技基础条件平台国家农作物种质资源平台云南子平台 |
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摘 要: | 为了解云南糯玉米地方品种糯性waxy基因的等位变异类型与构成,有针对性地保护和利用携带稀有基因的珍稀遗传材料,在用糯玉米已知基因wx-D7、wx-D10、wx-Cin4、wx-124和wx-Reina等的特异分子标记检测并获得携带有未知糯性基因的云南糯玉米地方品种基础上,设计出能检测waxy全基因的11对分子标记,检测10份带有未知waxy等位基因的云南糯玉米地方品种,发现来自云南曲靖市辖宣威市的糯玉米地方品种糯包谷(统一编号232248)带有的waxy基因的突变位点。用简化的热交错不对称PCR(Tail-PCR)对该突变位点作进一步扩增和测序,并分析包含突变点在内的waxy基因的分子特征。宣威糯包谷的waxy基因在其第14外显子中插入了约4.9 kb的未命名反转录转座子,本研究将其命名为xuanwei(宣威)。该反转录转座子属于长末端重复(Long terminal repeat,LTR)反转录转座子,具有序列完全相同的LTR结构。因此waxy基因wx-xuanwei是一个反转录转座子插入造成的新的等位突变基因。
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关 键 词: | 糯玉米 地方品种 waxy等位基因 反转录转座子 分子标记 |
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