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亚麻FAD基因家族的生物信息学鉴定分析
作者姓名:侯静静  赵利  王斌
作者单位:甘肃省农业科学院作物研究所,甘肃 兰州 730070
基金项目:国家自然科学基金(32160497、32160499);国家特色油料产业技术体系(CARS-14-1-03)。
摘    要:不饱和脂肪酸为人体提供基本代谢所必需的能量,须从膳食中补充。脂肪酸去饱和酶FAD(fatty acid desaturase)是植物不饱和脂肪酸合成途径中的关键酶,植物体内脂肪酸的各组分比例和不饱和度与FAD的去饱和作用息息相关。为探究亚麻FAD基因家族的表达与进化,为其在亚麻高品质育种中的应用提供理论依据。运用生物信息学方法对亚麻全基因组FAD基因家族的43个LuFADs基因进行分析。结果显示,该家族成员编码的蛋白质大小为152~453个氨基酸,大部分为碱性不稳定亲水蛋白。与拟南芥FADs蛋白序列构建系统发育树,可分为4个主要亚家族:Δ12/ω-3去饱和酶、“前端”去饱和酶、Δ7/Δ9去饱和酶和SAD去饱和酶。保守结构域和外显子-内含子结构分析得出,同一亚组中的家族成员具有较为相似的基因结构。染色体定位分析呈随机性分布。亚细胞定位预测得出,叶绿体上的家族成员最多。启动子顺式作用元件分析发现,该家族成员中抗氧化反应元件(ARE)数量最多。

关 键 词:亚麻  FAD基因家族  生物信息学分析
收稿时间:2022/11/28 0:00:00

Identification and Bioinformatics Analysis of FAD Gene Family in Linum usitatissimum L.
Authors:HOU Jingjing  ZHAO Li  WANG Bin
Institution:Institute of Crops, Gansu Academy of Agricultural Sciences, Lanzhou Gansu 730070, China
Abstract:
Keywords:Linum usitatissimum L    FAD gene family  Bioinformatics analysis
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