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玉米苗期根部比较转录组分析揭示耐盐性差异机制
引用本文:董菁,张春宵,刘学岩,金峰学,刘文平,吴委林,李晓辉. 玉米苗期根部比较转录组分析揭示耐盐性差异机制[J]. 玉米科学, 2023, 31(6): 30-40
作者姓名:董菁  张春宵  刘学岩  金峰学  刘文平  吴委林  李晓辉
作者单位:延边大学农学院, 吉林 延吉 133002;吉林省农业科学院玉米研究所, 吉林 公主岭 136100
基金项目:吉林省农业科技创新工程人才基金项目(CXGC2021RCY035)、吉林省科技厅重点研发项目(20200402024NC)
摘    要:以耐盐自交系郑58和盐敏感自交系昌7-2为材料,分析供试材料在无胁迫(CK)和200 mmol/L NaCl溶液胁迫下5 h的转录组数据。与无胁迫(CK)相比较,在郑58和昌7-2分别鉴定出390和421个上调、390和421个下调差异基因。对耐感材料间共同上调和郑58特有上调DEGs进行GO富集、REVIGO分析和KEGG富集分析以及重点通路分析结果表明:郑58和昌7-2间共同上调DEGs显著富集的条目包括对活性氧代谢过程的调节、内质网应激反应等GO条目;郑58特有上调显著富集含氧化合物的反应、对化学物质的反应等GO条目。共同上调DEGs仅在共单萜生物合成的代谢通路上显著富集;郑58特有上调DEGs在植物激素信号转导、苯丙烷生物合成等6个通路上显著富集。在植物激素信号转导、苯丙烷生物合成两个通路上分别有9和7个相关基因,耐盐自交系郑58上调的转录因子在MYB和NAC家族分布数量较多。植物激素信号转导、苯丙烷生物合成通路相关的基因以及MYB和NAC家族基因可能与玉米耐盐性密切相关。

关 键 词:玉米  苗期  耐盐  转录组  基因挖掘
收稿时间:2022-08-30

Comparative Transcriptome Analysis of Maize Seedling Root Reveals the Different Mechanism of Salt Tolerance
DONG Jing,ZHANG Chun-xiao,LIU Xue-yan,JIN Feng-xue,LIU Wen-ping,WU Wei-lin,LI Xiao-hui. Comparative Transcriptome Analysis of Maize Seedling Root Reveals the Different Mechanism of Salt Tolerance[J]. Journal of Maize Sciences, 2023, 31(6): 30-40
Authors:DONG Jing  ZHANG Chun-xiao  LIU Xue-yan  JIN Feng-xue  LIU Wen-ping  WU Wei-lin  LI Xiao-hui
Affiliation:Agricultural College, Yanbian University, Yanji 133002;Maize Research Institute, Jilin Academy of Agricultural Sciences, Gongzhuling 136100, China
Abstract:
Keywords:
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