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广东省两株猪源戊型肝炎病毒的分离鉴定及其全基因序列分析
引用本文:梁焕斌,张桂红,张亮权,王衡,王德刚,梁楚敏. 广东省两株猪源戊型肝炎病毒的分离鉴定及其全基因序列分析[J]. 中国预防兽医学报, 2013, 35(7)
作者姓名:梁焕斌  张桂红  张亮权  王衡  王德刚  梁楚敏
作者单位:华南农业大学兽医学院 农业部兽用疫苗创制重点实验室/广东省动物源性人畜共患病预防与控制重点实验室,广东广州,510642
基金项目:高等学校博士点学科专项科研基金,广东省科技计划项目
摘    要:为进一步了解广东省近年猪戊型肝炎病毒(HEV)基因组特点及其演化情况,本研究于2010年~2011年间从广东省不同地区猪场收集的69份病猪胆汁样品中,分离得到两株猪源HEV(命名为SS19和ZS11).采用通用引物通过PCR方法扩增病毒的全基因序列.应用DNAStar和MEGA 5基因分析软件,将分离株与24株不同基因型的HEV参考序列进行核苷酸全序列比对和遗传进化分析.结果显示,分离的两株猪源HEV SS19和ZS11的核苷酸序列相似性为95.6%,两个病毒分离株与基因Ⅳ型HEV各参考病毒株核苷酸序列最为接近,其相似性分别为83.2 %~94.5%和83.6 %~94.6%,并且均属于基因Ⅳ型HEV.实验结果表明,广东省HEV流行病毒株仍以基因Ⅳ型为主,病毒株之间存在一定的地域局限性.

关 键 词:猪戊型肝炎病毒  分离  鉴定  序列分析

Identification and genomic sequence analysis of two swine hepatitis E virus isolated from Guangdong
LIANG Huan-bin , ZHANG Gui-hong , ZHANG Liang-quan , WANG Heng , WANG De-gang , LIANG Chu-min. Identification and genomic sequence analysis of two swine hepatitis E virus isolated from Guangdong[J]. Chinese Journal of Preventive Veterinary Medicine, 2013, 35(7)
Authors:LIANG Huan-bin    ZHANG Gui-hong    ZHANG Liang-quan    WANG Heng    WANG De-gang    LIANG Chu-min
Abstract:
Keywords:hepatitis E virus  isolation  identification  sequence analysis
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