甜瓜β-氨基己糖苷酶基因家族的全基因组分析

茁-氨基己糖苷酶(茁-Hexosaminidase, 茁-Hex, EC 3.2.1.52)是生物界广泛存在的一种糖苷水解酶。通过全 基因组信息鉴定甜瓜茁-氨基己糖苷酶基因家族，初步在甜瓜全基因组数据库中发现5 个茁-Hex 基因成员，采用 Pfam 等在线软件预测候选蛋白的结构域，去除2 个不完整的基因，最后将筛选出的3 个基因与拟南芥、青椒、番茄、 可可树、谷子、葡萄和黄瓜的相应基因编码的蛋白序列进行进化分析比对、建立系统发生树和保守基序的预测分析。 结果表明，进化树亚族成员中基序相同，并且在保守区序列高度相似；亚族之间基序差异也较小，保守区序列也具有 较高相似性。