| 基于EST-SSR标记的野生榧树居群遗传多样性分析 |
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| 引用本文： | 陈焘,李杰峰,张迟,高樟贵,金航标,戴文圣,唐海英,张敏.基于EST-SSR标记的野生榧树居群遗传多样性分析[J].安徽农业大学学报,2020,47(2):224. |
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| 作者姓名： | 陈焘 李杰峰 张迟 高樟贵 金航标 戴文圣 唐海英 张敏 |
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| 作者单位： | 浙江农林大学亚热带森林培育国家重点实验室，杭州 311300;松阳县自然资源和规划局，松阳 323400;浙江农林大学亚热带森林培育国家重点实验室，杭州 311300; 景宁嘉树农业科技开发有限公司，景宁 323500;诸暨市自然资源和规划局，诸暨 311800;磐安县自然资源和规划局，磐安 322300 |
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| 基金项目： | 浙江省基础公益研究计划项目（LGN19C160005）, 松阳县科技计划项目（2017sy011）, 磐安县科技计划项目（201713）和浙江省农业新品种选育重大科技专项（2016C02052-12）共同资助。 |
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| 摘 要： | 对野生榧树居群进行遗传多样性分析,有利于榧树野生资源的开发和利用。利用基于榧树(Torreya grandis)种仁转录组开发的36对多态性EST-SSR引物,对5个野生榧树居群共142个单株的遗传多样性进行分析。通过聚类分析、STRUCTURER遗传结构分析、分子方差分析(AMOVA)和主坐标分析(PCoA)等方法分析居群遗传结构。结果表明,5个居群的平均等位基因数(N_a)为4.285 7～6.638 9,Shannon’s指数(I)为1.015 0～1.373 6,Nei's遗传多样性指数(H)为0.532 7～0.656 1。36个SSR位点的平均遗传分化指数F_(st)为0.261 9,平均近交系数F_(is)为0.398 1,平均基因流(N_m)为0.704 7。居群成对分析显示,除黄山-嵊州居群间以及嵊州-松阳居群间,其他居群间F_(st)均大于0.15,基因流大于1。分子方差分析表明5个榧树居群的遗传差异主要存在于居群内(72%)。居群的遗传结构分析显示,黎川与松阳居群的遗传结构比较相似,而诸暨居群、嵊州居群及黄山居群等3个居群的遗传结构差异较大。5个野生榧树居群具有较高的遗传多样性,居群遗传结构的分析结果与各居群的地理分布基本一致。
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| 关 键 词： | EST-SSR 榧树 遗传多样性 遗传结构 |
Genetic structure and diversity of wild populations in Torreya grandis determined with EST-SSR |
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| CHEN Tao,LI Jiefeng,ZHANG Chi,GAO Zhanggui,JIN Hangbiao,DAI Wensheng,TANG Haiying,ZHANG Min.Genetic structure and diversity of wild populations in Torreya grandis determined with EST-SSR[J].Journal of Anhui Agricultural University,2020,47(2):224. |
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| Authors: | CHEN Tao LI Jiefeng ZHANG Chi GAO Zhanggui JIN Hangbiao DAI Wensheng TANG Haiying ZHANG Min |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | EST-SSR Torreya grandis geneytic diversity population structure |
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