| 基于转录组测序挖掘马铃薯块茎采后发芽关键基因 |
| |
| 引用本文： | 吴林,杨苏渝,杨阳,廖喜梅,朱学栋,朱菲菲,梁峰铭,李勇,吕典秋.基于转录组测序挖掘马铃薯块茎采后发芽关键基因[J].西南大学学报,2023(11):70-80. |
| |
| 作者姓名： | 吴林 杨苏渝 杨阳 廖喜梅 朱学栋 朱菲菲 梁峰铭 李勇 吕典秋 |
| |
| 作者单位： | 1. 西南大学西部(重庆)科学城种质创制大科学中心;2. 西南大学农学与生物科技学院;3. 薯类生物学与遗传育种重庆市重点实验室;4. 重庆市渝东南农业科学院;6. 安顺学院农学院 |
| |
| 基金项目： | 国家重点研发计划项目(2018YFE0127900,2022YFD1201600)；;中央高校基本业务费专项(SWU-KR22042)；;贵州省普通高等学校青年科技人才成长项目(黔教合KY字146)； |
| |
| 摘 要： | 马铃薯是全球第4大粮食作物，营养丰富.然而，马铃薯块茎采后发芽显著影响其商品价值和种薯质量.该研究结合表型观察、细胞学分析、生理生化检测、植物激素含量测定、 Marker基因表达分析等，明确了马铃薯采后发芽的关键时期.通过对马铃薯块茎采后发芽关键时期样本进行RNA-seq分析，挖掘了马铃薯块茎采后发芽关键基因.结果表明‘费乌瑞它’马铃薯块茎采后休眠解除期为30 d,芽生长期为45 d.从休眠期到休眠解除期和休眠解除期到芽生长期分别有1 008个基因(252个上调、 756个下调)和4 576个基因(2 800个上调、 1 696个下调)表达量发生显著变化. 156个转录因子基因(主要属于AP2、 MYB和bHLH家族)及植物激素(ABA与GA)合成、代谢、信号转导相关基因，如NCED4,ZEP,KS,KO2,ABI5等.这些差异表达基因主要富集在苯丙烷生物合成(ko00940)、苯丙氨酸代谢(ko00360)、类胡萝卜素生物合成(ko00100)、 DNA复制(ko03030)、糖代谢(ko00520)等通路.
|
| 关 键 词： | 马铃薯块茎 采后发芽 转录组 关键基因 |
|
|
