|
|||||
|
|
| 拟南芥CBF4 基因位点的单核苷酸多态性(SNP)变化与抗旱表型的相应性 | |
| 引用本文： | 郝岗平,吴忠义,陈茂盛,曹鸣庆,黄丛林,杨清.拟南芥CBF4 基因位点的单核苷酸多态性(SNP)变化与抗旱表型的相应性[J].农业生物技术学报,2004,12(2):122-131. |
| 作者姓名： | 郝岗平 吴忠义 陈茂盛 曹鸣庆 黄丛林 杨清 |
| 作者单位： | 1. 南京农业大学生命科学学院,南京,210095;北京农业生物技术研究中心,北京,100089 2. 北京农业生物技术研究中心,北京,100089 3. Génétique et Amélionration des Plantes,INRA,78026,France 4. 南京农业大学生命科学学院,南京,210095 |
| 基金项目： | 北京市科委(No.H012010240240113,H020821150130),科技部中法PRA(中法PRABT02-2)和国家重大基础研究规划(973)项目(No.2003CB114300). |
| 摘 要： | 以生长于不同生态气候条件下的17个拟南芥(Arabidopsis thaliana)核心生态型为材料，分析了它们的相对抗旱性和抗旱转录因子CBF4基因的单核苷酸多态性(SNP)。结果表明，不同的拟南芥生态型具有差异明显的抗旱性。与拟南芥Columbia生态型相比，25av、203av和244av生态型的CBF4基因位点具有高密度的SNP和插入／缺失(Indel)，多态性的频率为每35．8bp 1个SNP，每143bp 1个Indel。Tajimma'S D统计学检验结果显示各区域都不显著，说明该区域核苷酸变化符合中性突变假说，较高的核苷酸多样性是净化选择的结果。基因非编码区的多态性是编码区的4倍，表明编码区承受着更大的选择压力。在编码区，SNP的频率为每96．4bp 1个SNP，其中1034位(以GenBank No．AB015478序列第19696位的核苷酸为1)碱基变化：G←→T，引起第205位氨基酸变化：gly←→val。而203av形成的haplotype6具有4个特异的SNP变化，其中5′端非编码区3个：27位的A←→G，129位的A←→C，171位的G←→A；3′端非编码区1个：1106位的A←→C。抗旱性鉴定结果表明203av拟南芥是抗旱性最强的一个生态型，研究认为haplotype6与它较强的抗旱性表型相应。 |
| 关 键 词： | 拟南芥 CBF4 基因位点 单核苷酸多态性 SNP 抗旱性状 生态型 分子遗传标记 |
| 修稿时间： | 2003年1月26日 |
Single Nucleotide Polymorphisms of CBF4 Locus Region of Arabidopsis thaliana Correspond to Drought Tolerance |
|
| Abstract: | |
| Keywords: | |
| 本文献已被 万方数据 等数据库收录！ | |
| 点击此处可从《农业生物技术学报》浏览原始摘要信息 | |