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| 斑点叉尾(鱼回)趋化因子基因SCYA113内含子1的多态性分析 | |
| 引用本文： | 宋文涛,高祥刚,孙凡越,刘星,刘卫东,刘莹,赫崇波.斑点叉尾(鱼回)趋化因子基因SCYA113内含子1的多态性分析[J].农业生物技术学报,2009,17(3). |
| 作者姓名： | 宋文涛 高祥刚 孙凡越 刘星 刘卫东 刘莹 赫崇波 |
| 作者单位： | 1. 辽宁省海洋水产科学研究院,辽宁省海洋水产分子生物学重点实验室,大连116023;辽宁师范大学生命科学学院,大连116029 2. 辽宁省海洋水产科学研究院,辽宁省海洋水产分子生物学重点实验室,大连116023 3. 辽宁省海洋水产科学研究院,辽宁省海洋水产分子生物学重点实验室,大连116023;大连水产学院生命科学与技术学院,大连116023 |
| 基金项目： | 国家自然科学基金，辽宁省海洋与渔业科研计划项目 |
| 摘 要： | 运用变性聚丙烯酰胺凝胶电泳(DPAGE)和PCR产物测序技术检测斑点叉尾(鱼回)(Ictalums punctatus)CC趋化因子基因SCYAll3内含子l的序列长度和多态性.在3个群体的60个个体中,斑点叉尾(鱼回)CC趋化SCYA113内含子1存在15种单元型和8种长度类型,长度类型分别为A、B、C、D、E、F、G和H型.对这8种序列进行比对分析发现,斑点又尾(鱼回)SCYA113内含子1长度为395～443 bp.8种长度类型中A、G、T、c的平均百分比分别为30.01%、15.43%、38.37%和16.19%,而且G+C(31.62%)含量明显小于A+T(68.38%)含量.内含子1与外显子1和2的连接处存在真核基因中mRNA剪接的识别信号GT/AG;引起长度变化的主要原因是短串联重复序列(微卫星序列)TTc和TTA引起的;除了微卫星序列以外,共检测到6个突变位点,其中3个转换位点为118(C→T)、209(G→A)和250(T→c),3个颠换位点为266(T→A)、289(G→T)和387(G→C),核苷酸多样性指数(π)为0.004,平均核苷酸差异(K)为1.576;在变异水平上,3个群体表现出一定的遗传差异,84群体中检测到8种长度类型和14种基因型.97群体中检测到8种长度类型和1O种基因型,04群体中6种长度类型和1O种基因型(缺少A、B等位基因).从3个群体60个个体拥有22种频率较低(O.017～0.150)的基因型可以看出,斑点叉尾(鱼回)的遗传基因资源较为丰富. |
| 关 键 词： | 斑点叉尾(鱼回) 趋化因子 内含子 单元型 多态性 |
Polymorphism Analysis of Intron l of Chemokine SCYA 113 in Channel Catfish (Ictalurus punctatus) |
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| SONG Wen-tao,GAO Xiang-gang,Sun Fan-yue,Liu Xing,LIU Wei-dong,LIU Ying,HE Chong-bo.Polymorphism Analysis of Intron l of Chemokine SCYA 113 in Channel Catfish (Ictalurus punctatus)[J].Journal of Agricultural Biotechnology,2009,17(3). | |
| Authors: | SONG Wen-tao GAO Xiang-gang Sun Fan-yue Liu Xing LIU Wei-dong LIU Ying HE Chong-bo |
| Abstract: | |
| Keywords: | SCYA113 |
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