| 基于全基因组的番茄YUCCA基因家族生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 莫福磊,束艺,陈秀玲,刘卓凡,孙妍,姜珊,李凤硕,王傲雪. 基于全基因组的番茄YUCCA基因家族生物信息学分析[J]. 分子植物育种, 2020, 0(10): 3159-3163 |
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| 作者姓名： | 莫福磊 束艺 陈秀玲 刘卓凡 孙妍 姜珊 李凤硕 王傲雪 |
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| 作者单位： | 东北农业大学生命科学学院;东北农业大学园艺园林学院;东北农业大学农学院 |
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| 基金项目： | 黑龙江省普通本科高等学校青年创新人才培养计划(UNPYSCT-2016135)资助。 |
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| 摘 要： | YUCCA基因是植物在合成生长素过程中限速酶的编码基因,植物在生长发育过程中离不开生长素,也同样也离不开YUCCA基因。为深入研究番茄中的YUCCA基因,本研究利用生物信息学方法,在番茄全基因组范围内共鉴定出了17个YUCCA基因,并对17个YUCCA基因的基本信息、转录本结构、保守基序、顺式元件、染色体定位、系统发育以及表达模式进行了分析。结果表明,17个YUCCA基因分布在7条染色体上,并且可以分为三大类A、B、C。YUCCA基因的内含子在0~7之间分布。系统发育分析表明,同一条染色体上的YUCCA基因有明显的进化关系。通过以上分析,对后续深入研究番茄YUCCA基因家族提供了参考。
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| 关 键 词： | 番茄(Solanum lycopersicum) YUCCA 生物信息学 基因家族 |
Bioinformatics Analysis of Tomato YUCCA Gene Family Based on Whole Genome |
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| Mo Fulei,Shu Yi,Chen Xiuling,Liu Zhuofan,Sun Yan,Jiang Shan,Li Fengshuo,Wang Aoxue. Bioinformatics Analysis of Tomato YUCCA Gene Family Based on Whole Genome[J]. Molecular Plant Breeding, 2020, 0(10): 3159-3163 |
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| Authors: | Mo Fulei Shu Yi Chen Xiuling Liu Zhuofan Sun Yan Jiang Shan Li Fengshuo Wang Aoxue |
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| Affiliation: | (College of Life Science,Northeast Agricultural University,Harbin,150000;College of Horticulture and Landscape Architecture,Northeast Agricultural University,Harbin,150000;College of Agriculture,Northeast Agricultural University,Harbin,150000) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Tomato(Solanum lycopersicum) YUCCA Bioinformatics Gene family |
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