| 红肉火龙果TST基因家族的生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 郑乾明,王小柯,马玉华. 红肉火龙果TST基因家族的生物信息学分析[J]. 贵州农业科学, 2020, 48(7): 60-63. DOI: 10.3969/j.issn.1001-3601.2020.07.014 |
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| 作者姓名： | 郑乾明 王小柯 马玉华 |
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| 作者单位： | 贵州省农业科学院果树科学研究所,贵州贵阳550006,贵州省农业科学院果树科学研究所,贵州贵阳550006,贵州省农业科学院果树科学研究所,贵州贵阳550006 |
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| 基金项目： | 贵州省科学技术基金项目“火龙果TST类糖转运子在果实可溶性糖积累过程中的功能研究”[黔科合基础(2017)1178 |
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| 摘 要： | 为分离参与红肉火龙果果实可溶性糖积累的功能基因,基于转录组测序数据克隆液泡糖转运蛋白(Tonoplast sugar transporter,TST)基因家族,进行序列同源性、跨膜结构、亚细胞定位和系统发育等生物信息学分析。结果表明:红肉火龙果含有4个TST基因,开放读码框(open reading frame,ORF)长度为2 127～2 235bp,编码长度为708～744个氨基酸的序列。预测等电点为4.84～5.36,相对分子量为75.7～80.4kDa;红肉火龙果TST家族氨基酸序列与甜菜和藜麦TST家族具有74.9%～83.4%的相似性;红肉火龙果TST成员均含11～12个跨膜结构域,定位于质体、叶绿体、液泡或内质网等细胞器。系统进化分析表明HpTST1属于TST1类,HpTST2.1和HpTST2.2属于TST2类,HpTST3属于TST3类。
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| 关 键 词： | 火龙果 可溶性糖 液泡 亚细胞定位 TST基因 |
Bioinformatics Analysis of TST Gene Family in Red Pitaya |
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| ZHENG Qianming,WANG Xiaoke,MA Yuhua. Bioinformatics Analysis of TST Gene Family in Red Pitaya[J]. Guizhou Agricultural Sciences, 2020, 48(7): 60-63. DOI: 10.3969/j.issn.1001-3601.2020.07.014 |
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| Authors: | ZHENG Qianming WANG Xiaoke MA Yuhua |
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