| 基于转录组测序的苦瓜热激蛋白相关基因分析 |
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| 引用本文： | 杜文丽,陈中钐,许端祥,徐同伟,高山,温庆放. 基于转录组测序的苦瓜热激蛋白相关基因分析[J]. 分子植物育种, 2020, 0(10): 3141-3149 |
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| 作者姓名： | 杜文丽 陈中钐 许端祥 徐同伟 高山 温庆放 |
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| 作者单位： | 福州市蔬菜科学研究所;福建省农业科学院作物研究所 |
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| 基金项目： | 福州市科技局项目(2019-N-1);福建省科技重大专项(2018NZ0002-3)共同资助。 |
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| 摘 要： | 为获得苦瓜叶片高温胁迫状态下表达的相关基因,本研究以高温胁迫下苦瓜叶片为实验材料,采用Illumina HiSeq 2500高通量测序技术对正常温度(26℃)和高温胁迫(38℃)下苦瓜叶片转录测序后进行组装,再利用KEGG、Pfam、Swiss-Prot和NR数据库平台对热激蛋白的相关功能基因筛选,共获得24个热激蛋白相关基因,包括得20个热激蛋白基因、2个位于叶绿体中的小热激蛋白以及2个热激转录因子。聚类分析研究表明,涉及到热激蛋白相关的20个Unigene广泛分布于3大类中,其中c42567和c43094这两个亲缘关系最近;两个小热激蛋白c42963和c12133的亲缘关系次之;c35683和c3040两个热激转录因子亲缘关系最远。通过本次研究中获取的24个热激蛋白相关Unigene信息,有助于深入研究苦瓜耐高温胁迫机理等提供数据信息。
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| 关 键 词： | 苦瓜(Momordica charantia L.) 转录组测序 功能注释 热激蛋白相关基因 |
Heat Shock Protein Related Gene Analysis of Momordica charantia Based on Transcriptome Sequencing |
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| Du Wenli,Chen Zhongshan,Xu Duanxiang,Xu Tongwei,Gao Shan,Wen Qingfang. Heat Shock Protein Related Gene Analysis of Momordica charantia Based on Transcriptome Sequencing[J]. Molecular Plant Breeding, 2020, 0(10): 3141-3149 |
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| Authors: | Du Wenli Chen Zhongshan Xu Duanxiang Xu Tongwei Gao Shan Wen Qingfang |
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| Affiliation: | (Fuzhou Institute of Vegetable Crops,Fuzhou,350111;Crops Research Institute,Fujian Academy of Agricultural Sciences,Fuzhou,350013) |
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