| 露地菊(Chrysanthemum×grandiflora)CgDREB基因克隆和生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 杨伊如,王琳,杨柳慧,刘彧,周蕴薇.露地菊(Chrysanthemum×grandiflora)CgDREB基因克隆和生物信息学分析[J].分子植物育种,2020(3):780-788. |
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| 作者姓名： | 杨伊如 王琳 杨柳慧 刘彧 周蕴薇 |
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| 作者单位： | 东北林业大学园林学院 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金(31870687)资助。 |
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| 摘 要： | DREB转录因子在植物抗逆过程中起关键性作用,它可以激活一系列抗逆功能基因的表达从而综合提高植物的抗逆性。为探究露地菊DREB基因的功能,本研究通过结合RNA-Seq和RT-PCR技术从露地菊‘纽9717’中克隆得到CgDREB基因,并对该基因及其蛋白进行生物信息学和表达模式分析。结果显示,CgDREB基因ORF全长450 bp,编码149个氨基酸,预测蛋白相对分子量16.742 kD,理论等电点9.32,为亲水性蛋白,没有跨膜结构,无信号肽。功能结构域分析表明其具有一个高度保守的AP2/ERF结构域。同源性分析其属于AP2/ERF转录因子家族DREB亚组A-5组。蛋白质二级结构中无规则卷曲占57.05%,α-螺旋占28.86%,延伸链占10.07%,β-转角占4.03%。三级结构显示其以单体蛋白结构存在。RT-qPCR分析表明,高盐、干旱、低温和ABA均能诱导CgDREB基因的表达。本研究为深入了解露地菊A-5组DREB转录因子及其抗逆调控机制提供基础,为露地菊品种改良提供理论依据。
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| 关 键 词： | 露地菊 DREB 基因克隆 |
Cloning and Bioinformatics Analysis of Cg DREB Gene from Chrysanthhemum×grandiflora |
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| Yang Yiru,Wang Lin,Yang Liuhui,Liu Yu,Zhou Yunwei.Cloning and Bioinformatics Analysis of Cg DREB Gene from Chrysanthhemum×grandiflora[J].Molecular Plant Breeding,2020(3):780-788. |
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| Authors: | Yang Yiru Wang Lin Yang Liuhui Liu Yu Zhou Yunwei |
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| Institution: | (College of Landscape Architecture,Northeast Forestry University,Harbin,150000) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Chrysanthemum×grandiflora DREB Gene cloning |
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