| 香蕉胚胎发育晚期丰富蛋白(MaLEA)家族生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 赵东方,苗红霞,刘菊华,贾彩红,王静毅,张建斌,王卓,金志强,徐碧玉. 香蕉胚胎发育晚期丰富蛋白(MaLEA)家族生物信息学分析[J]. 分子植物育种, 2020, 0(12): 3893-3901 |
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| 作者姓名： | 赵东方 苗红霞 刘菊华 贾彩红 王静毅 张建斌 王卓 金志强 徐碧玉 |
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| 作者单位： | 海南大学热带作物学院;中国热带农业科学院热带生物技术研究所 |
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| 基金项目： | 海南省自然科学基金创新研究团队项目(2019CXTD412);现代农业产业技术体系建设专项(CA-RS-31);中央级公益性科研院所基本科研业务费专项(1630052017010)共同资助。 |
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| 摘 要： | 晚期胚胎发育丰富蛋白(late embryogenesis abundant protein,LEA)普遍存在于植物中,该家族蛋白在非生物胁迫下大量积累以保护植物正常生长发育。为了探索MaLEA家族蛋白在调控香蕉非生物胁迫中的功能,本研究利用生物信息学方法对23个香蕉LEA家族的基因结构、理化性质、亚细胞定位、系统进化、表达特性及启动子进行初步研究。结果显示:MaLEA家族属于高度亲水蛋白,等电点在4.6~9.96之间,大多数定位于细胞质,同时在细胞核、叶绿体和线粒体也有分布。聚类分析发现MaLEA家族共分为7组,不同组间Motif存在一定差异;在启动子序列中,内含子数目为0~3。转录组数据显示,大多数MaLEA家族成员在香蕉果实发育的前期表达量较高;同时,MaLEA3、MaLEA5、MaLEA14和MaLEA23响应了干旱、盐和冷胁迫。进一步分析MaLEA家族基因启动子区响应元件,发现大量响应盐、干旱、高温、低温胁迫、机械损伤和茉莉酸甲酯、脱落酸激素等的顺式作用元件,推测MaLEA家族在非生物胁迫中发挥着重要作用,为深入研究香蕉MaLEA家族基因的功能提供了基础数据。
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| 关 键 词： | 香蕉(Musa nana Lour.) 胚胎发育晚期丰富蛋白 生物信息学分析 |
Bioinformatics Analysis of Musa nana Lour.Late Embryogenesis Abundant-Protein(MaLEA)Gene Family |
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| Zhao Dongfang,Miao Hongxia,Liu Juhua,Jia Caihong,Wang Jingyi,Zhang Jianbin,Wang Zhuo,Jin Zhiqiang,Xu Biyu. Bioinformatics Analysis of Musa nana Lour.Late Embryogenesis Abundant-Protein(MaLEA)Gene Family[J]. Molecular Plant Breeding, 2020, 0(12): 3893-3901 |
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| Authors: | Zhao Dongfang Miao Hongxia Liu Juhua Jia Caihong Wang Jingyi Zhang Jianbin Wang Zhuo Jin Zhiqiang Xu Biyu |
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| Affiliation: | (College of Tropical Crops,Hainan University,Haikou,570228;Key Laboratory of Biology and Genetic Resourcesof Tropical Crops,Ministry of Agriculture,Institute of Tropical Bioscience and Biotechnology,Chinese Academy of Trypical Agricultural Sciences,Haikou,571101) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Musa nana Lour. Late embryogenesis abundant protein family Bioinformatics analysis |
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