| 药用植物罗布麻的转录组测序及分析 |
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| 引用本文： | 赵雪艳,王琪,杨莎,张瑞瑞. 药用植物罗布麻的转录组测序及分析[J]. 分子植物育种, 2020, 0(8): 2503-2511 |
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| 作者姓名： | 赵雪艳 王琪 杨莎 张瑞瑞 |
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| 作者单位： | 陕西国际商贸学院 |
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| 基金项目： | 陕西省教育厅专项科研计划项目(18JK0953);国家自然科学基金(31500322)共同资助。 |
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| 摘 要： | 为了获得罗布麻转录组信息,研究罗布麻中功能基因的表达以及分子标记的开发,本研究采用Illumina HiSeq2000高通量测序技术对罗布麻进行转录组测序及分析。通过过滤掉低质量的读序,共获得26148138个高质量的读序,组装得到61538个Unigene序列。其中,有25296个Unigene在公共数据库中得到注释。通过KEGG分析,共发现29个Unigene参与活性成分(黄酮类)生物合成。检测出单核苷酸至六核苷酸重复类型的SSR位点13524个。本研究结果分析了参与黄酮类化合物合成的相关基因以及潜在的SSR位点,为进一步研究罗布麻次生代谢产物合成的功能基因的挖掘、分子标记的开发以及资源利用提供有用的信息。
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| 关 键 词： | 罗布麻(Apocynum venetum) 转录组 黄酮类化合物 SSR |
The Transcriptome Sequencing and Analysis of the Medicinal Plant Apocynum venetum |
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| Zhao Xueyan,Wang Qi,Yang Sha,Zhang Ruirui. The Transcriptome Sequencing and Analysis of the Medicinal Plant Apocynum venetum[J]. Molecular Plant Breeding, 2020, 0(8): 2503-2511 |
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| Authors: | Zhao Xueyan Wang Qi Yang Sha Zhang Ruirui |
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| Affiliation: | (Collaborative Innovation Center of Green Manufacturing Technology for Traditional Chinese Medicine in Shaanxi Province,Shaanxi Institute of International Trade and Commerce,Xianyang,712046) |
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