| 木薯叶芽和花芽的转录组差异分析 |
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| 引用本文： | 韦丽君,俞奔驰,吕平,檀小辉,雷开文,马崇熙,卢赛清,唐玉娟. 木薯叶芽和花芽的转录组差异分析[J]. 分子植物育种, 2020, 0(7): 2108-2117 |
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| 作者姓名： | 韦丽君 俞奔驰 吕平 檀小辉 雷开文 马崇熙 卢赛清 唐玉娟 |
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| 作者单位： | 广西壮族自治区亚热带作物研究所 |
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| 基金项目： | 广西自然科学基金项目(2017GXNSFBA198172);广西科技计划项目(桂科AB1850037,桂科AB16380080)共同资助。 |
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| 摘 要： | 本研究以木薯花芽与叶芽为材料,通过Illumina HiSeqTM4000测序平台对其进行转录组测序,结果获得高质量序列45 010 506个、碱基数13.46 Gb,GC含量在43.5%以上、比对效率在78%以上。筛选得到3 782个差异表达基因(DEGs),其中上调2 409个、下调1 373个。DEGs涉及的主要功能有一般功能预测,翻译,复制、重组与修复,信号传导机制,次生产物合成、运输与代谢,翻译后修饰、蛋白质周转和分子伴侣,氨基酸运输与代谢,碳水化合物运输与代谢。DEGs显著富集的KEGG通路主要有植物激素信号传导、苯丙烷类生物合成、淀粉和蔗糖代谢、苯丙氨酸代谢、氨基酸的生物合成和碳代谢。获得植物开花相关基因47个,其中39个上调表达、8个下调表达。研究结果在一定程度上解析了木薯花芽分化的分子机制,并为后续的深入研究提供了基础数据。
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| 关 键 词： | 木薯(Manihot esculenta) 转录组测序 花芽分化 开花基因 |
Transcriptome Difference Analysis of Cassava(Manihot esculenta) Leaf Bud and Flower Bud |
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| Wei Lijun,Yu Benchi,LüPing,Tan Xiaohui,Lei Kaiwen,Ma Chongxi,Lu Saiqing,Tang Yujuan. Transcriptome Difference Analysis of Cassava(Manihot esculenta) Leaf Bud and Flower Bud[J]. Molecular Plant Breeding, 2020, 0(7): 2108-2117 |
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| Authors: | Wei Lijun Yu Benchi LüPing Tan Xiaohui Lei Kaiwen Ma Chongxi Lu Saiqing Tang Yujuan |
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| Affiliation: | (Guangxi Subtropical Crops Research Institute,Nanning,530001) |
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