| 蓖麻NAC转录因子家族的鉴定及生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 代梦媛,高梅,李文昌. 蓖麻NAC转录因子家族的鉴定及生物信息学分析[J]. 分子植物育种, 2020, 0(6): 1808-1817 |
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| 作者姓名： | 代梦媛 高梅 李文昌 |
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| 作者单位： | 云南省农业科学院经济作物研究所 |
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| 基金项目： | 云南省应用基础研究计划青年项目(2018FD122)资助。 |
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| 摘 要： | NAC蛋白是植物特有的转录因子大家族,作用于植物生长发育和逆境胁迫响应,本研究基于蓖麻全基因组数据,利用生物信息学分析方法对蓖麻NAC转录因子家族成员、系统发育、编码蛋白的结构和理化性质进行分析。蓖麻NAC转录因子家族包括91个成员,分为14个亚族,其中蓖麻NAC转录因子Ⅻ亚族和Ⅻ亚族为蓖麻特有NAC蛋白;基因结构分析显示内含子数量为2~5个,Ⅻ亚族中12个成员缺少内含子;蛋白结构域分析显示Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ四个亚族蛋白质序列5个结构域(Motif)保守性较强,motif 2几乎存在所有蓖麻NAC蛋白中;与拟南芥105个NAC成员构建系统发育进化树,蓖麻58个NAC蛋白分别聚类到38个OGs,NAC转录因子的40个OGs中蓖麻缺少OG3b和OG7f;理化性质和结构分析显示蓖麻NAC蛋白质绝大多数是亲水氨基酸,二级结构以无规则卷曲为主,三级结构大部分相似。蓖麻具有很强的抗逆境胁迫能力,本研究为蓖麻耐性相关的NAC转录因子调控机理研究提供了科学依据。
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| 关 键 词： | 蓖麻 抗逆性 NAC转录因子 生物信息学 |
Identification and Bioinformatics Analysis of NAC Transcription Factor Family in Castor Bean |
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| Dai Mengyuan,Gao Mei,Li Wenchang. Identification and Bioinformatics Analysis of NAC Transcription Factor Family in Castor Bean[J]. Molecular Plant Breeding, 2020, 0(6): 1808-1817 |
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| Authors: | Dai Mengyuan Gao Mei Li Wenchang |
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| Affiliation: | (Cash Crop Research Institute,Yunnan Academy of Agricultural Sciences,Kunming,650205) |
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