| 大豆GmGRF5基因的组织表达模式与生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 徐思远,刘志雄,张晓玫. 大豆GmGRF5基因的组织表达模式与生物信息学分析[J]. 分子植物育种, 2020, 0(5): 1393-1400 |
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| 作者姓名： | 徐思远 刘志雄 张晓玫 |
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| 作者单位： | 长江大学园艺园林学院;中国农业科学院作物科学研究所 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目(31771714);转基因生物新品种培育重大专项(2016ZX08004-005,2018ZX08009-24B)共同资助。 |
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| 摘 要： | Growth Regulating Factor (GRF)家族基因是一类植物特有的转录因子,广泛参与植物多个重要的发育过程。为了研究大豆中的GRF转录因子的功能,本研究从大豆‘天隆1号’品种中克隆获得全长为1 038 bp的cDNA序列,由于该序列的编码蛋白与拟南芥GRF5具有高度的相似性,因此将其命名为GmGRF5基因。通过RT-PCR进行组织部位表达分析,发现GmGRF5基因在大豆各个组织部位均有表达,且在花中的表达量最高。通过ExPASy-Protparam分析发现,该蛋白质的分子量为39.463 48 kD,是具有一定亲水性、不稳定的碱性蛋白。该蛋白含有GRF家族蛋白的两个保守功能域(QLQ和WRC)。利用SOPMA对该蛋白的二级结构预测,显示其主要由无规则卷曲(72.05%)、α-螺旋(13.83%)、延伸链区(9.8%)和β-转角(4.32%)组成。此外,还利用不同的生物信息学软件对其三级结构、跨膜域、亚细胞定位、互作蛋白进行了分析,并构建系统进化树。结果表明,Gm GRF5基因在进化过程中具有高度的保守性,在大豆中具有潜在的功能多样性。
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| 关 键 词： | 大豆 GmGRF5 组织表达模式 生物信息学分析 |
Tissue Expression Pattern and Bioinformatics Analysis of GmGRF5 Gene in Soybean |
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| Xu Siyuan,Liu Zhixiong,Zhang Xiaomei. Tissue Expression Pattern and Bioinformatics Analysis of GmGRF5 Gene in Soybean[J]. Molecular Plant Breeding, 2020, 0(5): 1393-1400 |
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| Authors: | Xu Siyuan Liu Zhixiong Zhang Xiaomei |
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| Affiliation: | (College of Horticulture and Gardening,Yangtze University,Jingzhou,434023;MOA Key Lab of Soybean Biology(Beijing),National Key Facility for Crop Gene Resources and Genetic Improvement,Institute of Crop Science,Chinese Academy of Agricultural Sciences,Beijing,100081) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Soybean GmGRF5 Expression pattern Bioinformatics analysis |
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