| 亚麻(Linum usitatissimum)铅胁迫转录组初步分析 |
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| 引用本文： | 安霞,金关荣,陈杰,骆霞虹,陈常理,李文略,朱关林. 亚麻(Linum usitatissimum)铅胁迫转录组初步分析[J]. 分子植物育种, 2020, 0(10): 3185-3191 |
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| 作者姓名： | 安霞 金关荣 陈杰 骆霞虹 陈常理 李文略 朱关林 |
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| 作者单位： | 浙江省萧山棉麻研究所;华中农业大学生命科学技术学院 |
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| 基金项目： | 萧山区区级重大科技计划项目(2018227);国家麻类产业技术体系(CARS-16-S05)共同资助。 |
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| 摘 要： | 亚麻的不同器官具有多种商业价值。随着土壤重金属污染情况日益加剧,有必要对亚麻响应重金属污染的分子机理进行研究。本研究采用二代测序技术,对亚麻在铅胁迫下地上部位样品进行转录组分析。通过对原始测序数据进行质量控制,并利用HISAT软件等对处理后数据拼接到亚麻参考基因组,获得了高质量Unigenes和拼接结果。对Unigenes进行序列比对、功能注释和分类、序列变异分析。结果显示,本次测序结果共获得43471条Unigene,并且这些Unigenes的大部分(89.6%)都完全比对到参考基因组的预测外显子区域。对测序结果的KOG和KEGG分析结果表明亚麻在铅胁迫条件下可能影响的通路信息。最后,对测序结果进行转录因子预测和序列变异分析,为后续针对亚麻响应重金属胁迫的相关研究提供了候选分子资源。
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| 关 键 词： | 亚麻(Linum usitatissimum) 铅胁迫 转录组 序列变异 转录因子 |
Transcriptome Characterization Analysis of Linum usitatissimum under Pb Stress |
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| An Xia,Jin Guanrong,Chen Jie,Luo Xiahong,Chen Changli,LiWenlue,Zhu Guanlin. Transcriptome Characterization Analysis of Linum usitatissimum under Pb Stress[J]. Molecular Plant Breeding, 2020, 0(10): 3185-3191 |
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| Authors: | An Xia Jin Guanrong Chen Jie Luo Xiahong Chen Changli LiWenlue Zhu Guanlin |
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| Affiliation: | (Zhejiang Xiaoshan Institute of Cotton&Bast Fiber Crops Research,Research&Development Center of Flower,Zhejiang Academy of Agricultural Science,Hangzhou,311251;College of Life Science and Technolog of Huazhong Agricultural University,Wuhan,430070) |
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